195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1307 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1307  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
439 aa  857    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10690  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  68.37 
 
 
446 aa  531  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0933  nicotinate phosphoribosyltransferase  69.88 
 
 
424 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.570353  normal  0.55165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1489  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.44 
 
 
433 aa  531  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1722  Nicotinate phosphoribosyltransferase  68.16 
 
 
428 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.0930389 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2373  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.68 
 
 
438 aa  524  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2318  nicotinate phosphoribosyltransferase  64.49 
 
 
442 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000251567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0380  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.36 
 
 
433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132237  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2586  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  63.08 
 
 
442 aa  514  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1692  nicotinate phosphoribosyltransferase  65.06 
 
 
443 aa  508  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  hitchhiker  0.00000832621 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08320  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  64.29 
 
 
450 aa  504  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2828  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  62.79 
 
 
440 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11088  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3876  nicotinate phosphoribosyltransferase  69.72 
 
 
450 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.210079  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25100  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  65.21 
 
 
440 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1052  nicotinate phosphoribosyltransferase  62.33 
 
 
465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1352  nicotinate phosphoribosyltransferase  65.96 
 
 
427 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2742  nicotinate phosphoribosyltransferase  63.47 
 
 
442 aa  456  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1004  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.74 
 
 
437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704184  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3767  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  64.22 
 
 
430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2863  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.47 
 
 
454 aa  439  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0781042  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0882  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.01 
 
 
443 aa  440  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1693  nicotinate phosphoribosyltransferase  58.99 
 
 
438 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0334582  normal  0.146455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3854  nicotinate phosphoribosyltransferase  62.47 
 
 
440 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0484851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3928  nicotinate phosphoribosyltransferase  62.47 
 
 
440 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3840  nicotinate phosphoribosyltransferase  62.47 
 
 
440 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0914379  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29240  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  60.9 
 
 
433 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1959  nicotinate phosphoribosyltransferase  58.03 
 
 
439 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1320  nicotinate phosphoribosyltransferase  60.5 
 
 
465 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6984  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20100  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  56.92 
 
 
462 aa  425  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11362  nicotinate phosphoribosyltransferase  59.12 
 
 
448 aa  425  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000455701  normal  0.17111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2348  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.52 
 
 
454 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.243675  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0330  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  52.27 
 
 
445 aa  424  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1032  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.41 
 
 
440 aa  421  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1097  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  57.38 
 
 
428 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5658  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.36 
 
 
473 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4297  nicotinate phosphoribosyltransferase  60 
 
 
454 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0860  nicotinate phosphoribosyltransferase  59.13 
 
 
461 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1520  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.31 
 
 
432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0986  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  57.62 
 
 
428 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.937586  normal  0.155542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1286  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.44 
 
 
455 aa  385  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1559  nicotinate phosphoribosyltransferase  47.76 
 
 
443 aa  296  5e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4654  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
453 aa  243  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3577  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
453 aa  243  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  0.771098 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.81 
 
 
462 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0195  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.04 
 
 
453 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0513  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.03 
 
 
487 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0284  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.94 
 
 
488 aa  236  6e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2593  nicotinate phosphoribosyltransferase related  35.36 
 
 
458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46230  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.91 
 
 
452 aa  234  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0939  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.33 
 
 
451 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6179  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.37 
 
 
458 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0797  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.06 
 
 
485 aa  232  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0775  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 
451 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0511  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.75 
 
 
487 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0763  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 
451 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2057  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.71 
 
 
445 aa  230  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0664  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
487 aa  230  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0507  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.75 
 
 
487 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0509  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.75 
 
 
487 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0724  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.75 
 
 
487 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2987  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.66 
 
 
479 aa  229  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0635  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
487 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.821455  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0827  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.85 
 
 
460 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4703  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
487 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101236 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0653  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
487 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000067551 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0565  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
487 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0596  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
487 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4911  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 
489 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489735  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.91 
 
 
480 aa  227  3e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10583  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.75 
 
 
463 aa  226  7e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.127794  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5927  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 
459 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1180  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.97 
 
 
458 aa  224  2e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.690233  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0528  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.84 
 
 
498 aa  224  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.633345  unclonable  0.0000000475164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1046  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.65 
 
 
489 aa  222  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0174  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.61 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.440374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1538  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.37 
 
 
491 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0625  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.95 
 
 
453 aa  221  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1177  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.08 
 
 
486 aa  219  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0494715  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0281  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.61 
 
 
456 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.168647  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0996  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.72 
 
 
501 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0354541  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3666  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.49 
 
 
495 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335827  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1212  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  36.24 
 
 
446 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0255  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 
456 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2471  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
451 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0320218  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2627  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.62 
 
 
489 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.17 
 
 
457 aa  217  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.275384  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09180  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  37.03 
 
 
489 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.346116 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1417  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.22 
 
 
490 aa  216  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1227  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.22 
 
 
490 aa  216  8e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.507813  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1009  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.72 
 
 
460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.948322  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0227  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.42 
 
 
456 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1202  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.42 
 
 
490 aa  213  7e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1985  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.27 
 
 
447 aa  212  9e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000236264  hitchhiker  0.00837081 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0344  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
467 aa  212  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1969  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 
489 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.411515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2003  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 
489 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.675811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2646  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.84 
 
 
450 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159209  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1450  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.61 
 
 
489 aa  211  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.532365  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1528  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 
490 aa  208  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0273  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
484 aa  207  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>