202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20100 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_20100  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
462 aa  909    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0933  nicotinate phosphoribosyltransferase  63.68 
 
 
424 aa  435  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.570353  normal  0.55165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2742  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.81 
 
 
442 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1722  Nicotinate phosphoribosyltransferase  56.83 
 
 
428 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.0930389 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0882  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
443 aa  416  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25100  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  56.03 
 
 
440 aa  418  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1052  nicotinate phosphoribosyltransferase  54.91 
 
 
465 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2318  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.99 
 
 
442 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000251567 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2373  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
438 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2586  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  52.55 
 
 
442 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2828  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
440 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11088  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10690  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  55.03 
 
 
446 aa  413  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0380  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 
433 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132237  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1320  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.35 
 
 
465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6984  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1489  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.67 
 
 
433 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2863  nicotinate phosphoribosyltransferase  55.12 
 
 
454 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0781042  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1307  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.92 
 
 
439 aa  402  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3876  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.11 
 
 
450 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.210079  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0330  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  55.24 
 
 
445 aa  397  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1004  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.54 
 
 
437 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704184  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1692  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.47 
 
 
443 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  hitchhiker  0.00000832621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29240  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  54.5 
 
 
433 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1032  nicotinate phosphoribosyltransferase  50.44 
 
 
440 aa  391  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1352  nicotinate phosphoribosyltransferase  55.75 
 
 
427 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08320  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  50.78 
 
 
450 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1097  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  57.88 
 
 
428 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5658  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.94 
 
 
473 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1959  nicotinate phosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
439 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0860  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.48 
 
 
461 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3767  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  54.46 
 
 
430 aa  372  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1520  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.23 
 
 
432 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1693  nicotinate phosphoribosyltransferase  58.97 
 
 
438 aa  363  4e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0334582  normal  0.146455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0986  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  59.49 
 
 
428 aa  360  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.937586  normal  0.155542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4297  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.75 
 
 
454 aa  353  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3854  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.19 
 
 
440 aa  353  5e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0484851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3928  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.19 
 
 
440 aa  353  5e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3840  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.19 
 
 
440 aa  353  5e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0914379  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11362  nicotinate phosphoribosyltransferase  50.55 
 
 
448 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000455701  normal  0.17111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2348  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.21 
 
 
454 aa  344  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.243675  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1286  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.64 
 
 
455 aa  329  6e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1559  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.28 
 
 
443 aa  276  4e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0996  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.26 
 
 
501 aa  270  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0354541  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4654  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.9 
 
 
453 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3577  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.9 
 
 
453 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  0.771098 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.57 
 
 
462 aa  243  5e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1538  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.97 
 
 
491 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0664  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.28 
 
 
487 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0724  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.51 
 
 
487 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0507  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.51 
 
 
487 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0509  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.51 
 
 
487 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4703  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.28 
 
 
487 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0635  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.28 
 
 
487 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.821455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0653  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.28 
 
 
487 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000067551 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0565  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.28 
 
 
487 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0596  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.28 
 
 
487 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0513  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.05 
 
 
487 aa  236  7e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0511  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.62 
 
 
487 aa  236  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0797  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.15 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2627  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 
489 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0827  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 
460 aa  234  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1212  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  40.5 
 
 
446 aa  234  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1009  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 
460 aa  233  8.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.948322  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5927  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.39 
 
 
459 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6179  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.95 
 
 
458 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2987  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.95 
 
 
479 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0528  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.96 
 
 
498 aa  231  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.633345  unclonable  0.0000000475164 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1528  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.99 
 
 
490 aa  231  3e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0195  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.21 
 
 
453 aa  230  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1450  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
489 aa  229  8e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.532365  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1780  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.97 
 
 
441 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1985  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.17 
 
 
447 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000236264  hitchhiker  0.00837081 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2593  nicotinate phosphoribosyltransferase related  38.53 
 
 
458 aa  227  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1180  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 
458 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.690233  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1969  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 
489 aa  226  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.411515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2003  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 
489 aa  226  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.675811  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0284  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.03 
 
 
488 aa  225  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0174  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.9 
 
 
478 aa  225  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.440374  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10583  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.24 
 
 
463 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.127794  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0255  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.97 
 
 
456 aa  223  4e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2057  nicotinate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
445 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134189  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0281  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.73 
 
 
456 aa  223  7e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.168647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1177  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.01 
 
 
486 aa  222  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0494715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46230  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.5 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0113  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  34.54 
 
 
476 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1046  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.18 
 
 
489 aa  222  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1215  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.97 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0939  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.72 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0763  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.72 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0775  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.44 
 
 
451 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344543  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3836  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.49 
 
 
485 aa  219  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0322574  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0227  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.25 
 
 
456 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4911  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.84 
 
 
489 aa  217  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489735  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1540  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.94 
 
 
480 aa  216  5.9999999999999996e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.809941  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09180  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 
489 aa  215  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.346116 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0295  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.59 
 
 
486 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.93 
 
 
477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0273  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.03 
 
 
484 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1202  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.26 
 
 
490 aa  213  7e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0890  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 
475 aa  213  7e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3666  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.54 
 
 
495 aa  213  7.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335827  normal  0.432881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>