249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1780 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1780  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
441 aa  896    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0827  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.25 
 
 
460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4654  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.09 
 
 
453 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3577  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.09 
 
 
453 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  0.771098 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1985  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.97 
 
 
447 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000236264  hitchhiker  0.00837081 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46230  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.83 
 
 
452 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2760  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.48 
 
 
449 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
457 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.275384  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0939  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.64 
 
 
451 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0775  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.41 
 
 
451 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344543  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0763  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.41 
 
 
451 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0625  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 
453 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2057  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.47 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1009  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.58 
 
 
460 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.948322  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5927  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.97 
 
 
459 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6179  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.23 
 
 
458 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2602  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.35 
 
 
461 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10583  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.36 
 
 
463 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.127794  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0122  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.83 
 
 
465 aa  355  8.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0195  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
453 aa  352  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.65 
 
 
462 aa  333  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1215  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
451 aa  333  3e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2471  nicotinate phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 
451 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0320218  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1212  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  40.61 
 
 
446 aa  317  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2646  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.94 
 
 
450 aa  313  4.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159209  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0996  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.41 
 
 
501 aa  294  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0354541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0797  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.87 
 
 
485 aa  293  6e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1046  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 
489 aa  287  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2593  nicotinate phosphoribosyltransferase related  38.57 
 
 
458 aa  286  7e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0293  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.13 
 
 
458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0318  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0113  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  37.83 
 
 
476 aa  282  1e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3220  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.95 
 
 
458 aa  281  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4911  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 
489 aa  280  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489735  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2289  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.82 
 
 
481 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2236  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.6 
 
 
465 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.605686 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2373  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.57 
 
 
476 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0112042  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1758  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.08 
 
 
475 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0632  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
505 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.037982 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1969  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 
489 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.411515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2003  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 
489 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.675811  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5746  nicotinate phosphoribosyltransferase  43 
 
 
523 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0890  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 
475 aa  268  1e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1538  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.93 
 
 
491 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1011  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 
468 aa  266  5e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0528  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 
498 aa  266  5.999999999999999e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.633345  unclonable  0.0000000475164 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0273  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.87 
 
 
484 aa  266  8e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.32 
 
 
468 aa  265  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2627  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.22 
 
 
489 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0513  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.4 
 
 
487 aa  265  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0271  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.27 
 
 
451 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0174  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 
478 aa  263  4e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.440374  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.71 
 
 
477 aa  263  4.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1528  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 
490 aa  263  6e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2987  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 
479 aa  261  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0414  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.33 
 
 
459 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1540  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 
480 aa  261  1e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.809941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4703  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 
487 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101236 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2253  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.51 
 
 
484 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0507  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 
487 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0509  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 
487 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0724  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 
487 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3836  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
485 aa  260  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0322574  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0271  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.27 
 
 
451 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0635  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 
487 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.821455  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
480 aa  259  7e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1177  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.7 
 
 
486 aa  259  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0494715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0653  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 
487 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000067551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0511  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.34 
 
 
487 aa  259  9e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0565  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 
487 aa  259  9e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1071  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.18 
 
 
483 aa  259  9e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000207171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0596  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 
487 aa  259  9e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0664  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 
487 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38019  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1148  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.97 
 
 
486 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.24916  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1964  nicotinate phosphoribosyltransferase  35 
 
 
484 aa  256  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0253491  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0281  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.94 
 
 
456 aa  256  8e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.168647  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0284  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 
488 aa  255  8e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1450  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.72 
 
 
489 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.532365  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16160  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  37.4 
 
 
486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1417  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.52 
 
 
490 aa  254  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1227  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.52 
 
 
490 aa  254  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.507813  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.57 
 
 
486 aa  253  5.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.914728  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09180  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  35.91 
 
 
489 aa  252  8.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.346116 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0255  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.75 
 
 
456 aa  252  9.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1202  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 
490 aa  251  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3666  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.62 
 
 
495 aa  250  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335827  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1180  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.77 
 
 
458 aa  249  6e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.690233  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0344  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 
467 aa  249  9e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0322  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 
467 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0227  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.26 
 
 
456 aa  247  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1004  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.38 
 
 
437 aa  246  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704184  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0295  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.46 
 
 
486 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3722  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
491 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.790728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1722  Nicotinate phosphoribosyltransferase  37.67 
 
 
428 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.0930389 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3805  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 
491 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29240  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  39.19 
 
 
433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0655  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
481 aa  233  7.000000000000001e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0933  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.24 
 
 
424 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.570353  normal  0.55165 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3664  nicotinate phosphoribosyltransferase related  33.69 
 
 
491 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.211664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3792  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 
491 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.94991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>