275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6179 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6179  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
458 aa  919    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5927  nicotinate phosphoribosyltransferase  86.24 
 
 
459 aa  789    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0939  nicotinate phosphoribosyltransferase  68.72 
 
 
451 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0775  nicotinate phosphoribosyltransferase  68.47 
 
 
451 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344543  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0763  nicotinate phosphoribosyltransferase  68.72 
 
 
451 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4654  nicotinate phosphoribosyltransferase  66.51 
 
 
453 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3577  nicotinate phosphoribosyltransferase  66.51 
 
 
453 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  0.771098 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0625  nicotinate phosphoribosyltransferase  66.26 
 
 
453 aa  521  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46230  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.64 
 
 
452 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0827  nicotinate phosphoribosyltransferase  62.68 
 
 
460 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2760  nicotinate phosphoribosyltransferase  59.82 
 
 
449 aa  480  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  58.58 
 
 
457 aa  462  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2057  nicotinate phosphoribosyltransferase  59.48 
 
 
445 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134189  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1985  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.18 
 
 
447 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000236264  hitchhiker  0.00837081 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1215  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.03 
 
 
451 aa  392  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2602  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.04 
 
 
461 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0122  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.21 
 
 
465 aa  375  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1009  nicotinate phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 
460 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.948322  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0195  nicotinate phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
453 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10583  nicotinate phosphoribosyltransferase  50.12 
 
 
463 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.127794  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  47.38 
 
 
462 aa  361  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1212  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  45.85 
 
 
446 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1780  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.23 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2471  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.62 
 
 
451 aa  308  9e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0320218  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2646  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
450 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159209  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0797  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.38 
 
 
485 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2253  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1964  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.82 
 
 
484 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0253491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1758  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 
475 aa  280  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1011  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
468 aa  279  6e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3836  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 
485 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0322574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.26 
 
 
468 aa  277  3e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0284  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 
488 aa  276  5e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2289  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.4 
 
 
481 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1538  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.68 
 
 
491 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0174  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.08 
 
 
478 aa  273  5.000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.440374  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0996  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.38 
 
 
501 aa  273  7e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0354541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0344  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 
467 aa  272  9e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0322  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 
467 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0293  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 
458 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.05 
 
 
480 aa  271  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1071  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.25 
 
 
483 aa  269  8e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000207171  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0271  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.24 
 
 
451 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2593  nicotinate phosphoribosyltransferase related  34.61 
 
 
458 aa  268  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0113  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  38.4 
 
 
476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1177  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.74 
 
 
486 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0494715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2627  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.43 
 
 
489 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0271  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.79 
 
 
451 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1046  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.63 
 
 
489 aa  261  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3220  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.93 
 
 
458 aa  260  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0724  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.4 
 
 
487 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4703  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
487 aa  259  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101236 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2373  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.52 
 
 
476 aa  259  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0112042  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0653  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
487 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000067551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0635  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
487 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.821455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0664  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
487 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0507  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.4 
 
 
487 aa  259  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0509  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.4 
 
 
487 aa  259  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2003  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.49 
 
 
489 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.675811  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1969  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.49 
 
 
489 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.411515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0565  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
487 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0596  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
487 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0513  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
487 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4911  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.29 
 
 
489 aa  256  8e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489735  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0511  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
487 aa  255  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0414  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.29 
 
 
459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1528  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.08 
 
 
490 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1450  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
489 aa  253  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.532365  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2236  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.82 
 
 
465 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.605686 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0890  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 
475 aa  254  3e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0255  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.21 
 
 
456 aa  254  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1180  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 
458 aa  251  1e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.690233  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0318  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.73 
 
 
459 aa  252  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2987  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.53 
 
 
479 aa  252  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0227  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 
456 aa  251  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.81 
 
 
477 aa  250  4e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1540  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.03 
 
 
480 aa  249  9e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.809941  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0281  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 
456 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.168647  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.61 
 
 
486 aa  247  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.914728  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5746  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.8 
 
 
523 aa  247  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16160  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  35.01 
 
 
486 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0528  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 
498 aa  244  3e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.633345  unclonable  0.0000000475164 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0273  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 
484 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1202  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.08 
 
 
490 aa  243  6e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1417  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.43 
 
 
490 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1227  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.43 
 
 
490 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.507813  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0632  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.32 
 
 
505 aa  240  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.037982 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0295  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.88 
 
 
486 aa  239  8e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3792  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  38.85 
 
 
491 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.94991 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1148  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 
486 aa  237  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.24916  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3666  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.87 
 
 
495 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335827  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09180  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  36.63 
 
 
489 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.346116 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3722  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.92 
 
 
491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.790728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3805  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.65 
 
 
491 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3664  nicotinate phosphoribosyltransferase related  38.38 
 
 
491 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.211664  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1692  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.91 
 
 
443 aa  231  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  hitchhiker  0.00000832621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1097  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  38.88 
 
 
428 aa  230  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0380  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.55 
 
 
433 aa  229  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132237  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2373  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.05 
 
 
438 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08320  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 
450 aa  228  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>