246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3928 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3854  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
440 aa  862    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0484851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3928  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
440 aa  862    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4297  nicotinate phosphoribosyltransferase  80.64 
 
 
454 aa  646    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3840  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
440 aa  862    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0914379  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2348  nicotinate phosphoribosyltransferase  80.5 
 
 
454 aa  633  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.243675  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11362  nicotinate phosphoribosyltransferase  74.36 
 
 
448 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000455701  normal  0.17111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1959  nicotinate phosphoribosyltransferase  69.44 
 
 
439 aa  556  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1004  nicotinate phosphoribosyltransferase  69.07 
 
 
437 aa  531  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704184  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29240  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  68.62 
 
 
433 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1286  nicotinate phosphoribosyltransferase  68.75 
 
 
455 aa  510  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1693  nicotinate phosphoribosyltransferase  66.43 
 
 
438 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0334582  normal  0.146455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3767  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  67.13 
 
 
430 aa  481  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1097  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  62.47 
 
 
428 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1520  nicotinate phosphoribosyltransferase  64.34 
 
 
432 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0986  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  62.24 
 
 
428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.937586  normal  0.155542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1722  Nicotinate phosphoribosyltransferase  60.46 
 
 
428 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.0930389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1489  nicotinate phosphoribosyltransferase  60.73 
 
 
433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2742  nicotinate phosphoribosyltransferase  62.05 
 
 
442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2373  nicotinate phosphoribosyltransferase  60.6 
 
 
438 aa  442  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0933  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.77 
 
 
424 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.570353  normal  0.55165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0380  nicotinate phosphoribosyltransferase  60.6 
 
 
433 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132237  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1052  nicotinate phosphoribosyltransferase  60.23 
 
 
465 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1692  nicotinate phosphoribosyltransferase  59.27 
 
 
443 aa  432  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  hitchhiker  0.00000832621 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1307  nicotinate phosphoribosyltransferase  62.47 
 
 
439 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1352  nicotinate phosphoribosyltransferase  64.25 
 
 
427 aa  428  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3876  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.78 
 
 
450 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.210079  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10690  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  59.68 
 
 
446 aa  419  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08320  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  57.8 
 
 
450 aa  414  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2863  nicotinate phosphoribosyltransferase  59.16 
 
 
454 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0781042  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5658  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.4 
 
 
473 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1320  nicotinate phosphoribosyltransferase  60.4 
 
 
465 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6984  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25100  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  58.45 
 
 
440 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2828  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  56.12 
 
 
440 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2318  nicotinate phosphoribosyltransferase  55.2 
 
 
442 aa  398  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000251567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2586  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  54.92 
 
 
442 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0330  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  49.66 
 
 
445 aa  390  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0882  nicotinate phosphoribosyltransferase  55.73 
 
 
443 aa  388  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0860  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.28 
 
 
461 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1032  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.13 
 
 
440 aa  374  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20100  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  52.19 
 
 
462 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1559  nicotinate phosphoribosyltransferase  50.84 
 
 
443 aa  292  9e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3577  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.95 
 
 
453 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  0.771098 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4654  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.95 
 
 
453 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.34 
 
 
462 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0511  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.51 
 
 
487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0664  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.51 
 
 
487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4703  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.51 
 
 
487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101236 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0513  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.21 
 
 
487 aa  233  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0507  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.21 
 
 
487 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0509  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.21 
 
 
487 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0635  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.51 
 
 
487 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.821455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0724  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.21 
 
 
487 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1212  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 
446 aa  233  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0653  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
487 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000067551 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0565  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
487 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0596  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
487 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2602  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.3 
 
 
461 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2593  nicotinate phosphoribosyltransferase related  35.29 
 
 
458 aa  230  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.56 
 
 
457 aa  228  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.275384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0797  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.76 
 
 
485 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2057  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.44 
 
 
445 aa  226  7e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134189  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0284  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 
488 aa  224  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10583  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.66 
 
 
463 aa  224  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.127794  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6179  nicotinate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
458 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1177  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.53 
 
 
486 aa  222  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0494715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0996  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.27 
 
 
501 aa  222  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0354541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0939  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0763  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1540  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.03 
 
 
480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.809941  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0195  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.22 
 
 
453 aa  221  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0775  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.59 
 
 
451 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344543  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1180  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
458 aa  219  7e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.690233  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1009  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.32 
 
 
460 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.948322  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2471  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.28 
 
 
451 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0320218  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2987  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
479 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46230  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.59 
 
 
452 aa  217  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1202  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 
490 aa  215  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1780  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.4 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1148  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.71 
 
 
486 aa  213  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.24916  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2646  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 
450 aa  213  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159209  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1046  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.01 
 
 
489 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0890  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.68 
 
 
475 aa  212  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5927  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.64 
 
 
459 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3836  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 
485 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0322574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2253  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.07 
 
 
484 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16160  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 
486 aa  211  3e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1528  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.32 
 
 
490 aa  210  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1964  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.07 
 
 
484 aa  209  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0253491  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0625  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
453 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0295  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 
486 aa  209  8e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0273  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.65 
 
 
484 aa  209  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1538  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.84 
 
 
491 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0827  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.89 
 
 
460 aa  208  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0528  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.67 
 
 
498 aa  207  4e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.633345  unclonable  0.0000000475164 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1227  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.52 
 
 
490 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.507813  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09180  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
489 aa  206  8e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.346116 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
477 aa  206  8e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3666  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.45 
 
 
495 aa  206  9e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335827  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2627  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.53 
 
 
489 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1417  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.52 
 
 
490 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>