259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0330 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0330  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 445 aa  919    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1032  nicotinate phosphoribosyltransferase  77.75 
 
 		 440 aa  682    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1052  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.59 
 
 		 465 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25100  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  54.85 
 
 		 440 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2318  nicotinate phosphoribosyltransferase  54.92 
 
 		 442 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000251567 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2742  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.91 
 
 		 442 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1722  Nicotinate phosphoribosyltransferase  53.41 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.0930389 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2586  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  53.78 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0933  nicotinate phosphoribosyltransferase  54.71 
 
 		 424 aa  442  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.570353  normal  0.55165 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08320  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  54.9 
 
 		 450 aa  439  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1320  nicotinate phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6984  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2828  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  53.55 
 
 		 440 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1489  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.62 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2373  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.62 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0882  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.95 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3876  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.97 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.210079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0380  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.94 
 
 		 433 aa  420  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1692  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.81 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  hitchhiker  0.00000832621 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1307  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.27 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1097  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  49.55 
 
 		 428 aa  411  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10690  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 		 446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1004  nicotinate phosphoribosyltransferase  50.92 
 
 		 437 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704184  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2863  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.15 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0781042  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20100  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  55.24 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1959  nicotinate phosphoribosyltransferase  49.89 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0986  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  50.68 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.937586  normal  0.155542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1693  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.17 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0334582  normal  0.146455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1352  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.46 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29240  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  51.5 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1520  nicotinate phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3767  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  51.93 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1286  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.02 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5658  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.96 
 
 		 473 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3854  nicotinate phosphoribosyltransferase  49.66 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0484851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3928  nicotinate phosphoribosyltransferase  49.66 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11362  nicotinate phosphoribosyltransferase  49.66 
 
 		 448 aa  372  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000455701  normal  0.17111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3840  nicotinate phosphoribosyltransferase  49.66 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0914379  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2348  nicotinate phosphoribosyltransferase  50.11 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.243675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4297  nicotinate phosphoribosyltransferase  49.45 
 
 		 454 aa  362  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0860  nicotinate phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1559  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.14 
 
 		 443 aa  276  5e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0513  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.97 
 
 		 487 aa  263  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0664  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.43 
 
 		 487 aa  262  8e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0635  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.07 
 
 		 487 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.821455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4703  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.97 
 
 		 487 aa  256  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101236 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0724  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.44 
 
 		 487 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0507  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.44 
 
 		 487 aa  255  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0509  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.44 
 
 		 487 aa  255  9e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0565  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.52 
 
 		 487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0596  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.52 
 
 		 487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0511  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.12 
 
 		 487 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0653  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 		 487 aa  252  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000067551 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1528  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.61 
 
 		 490 aa  248  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1202  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.06 
 
 		 490 aa  248  2e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0797  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.18 
 
 		 485 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1538  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.61 
 
 		 491 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0284  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.91 
 
 		 488 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0763  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.89 
 
 		 451 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2593  nicotinate phosphoribosyltransferase related  36.15 
 
 		 458 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0273  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.22 
 
 		 484 aa  241  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0939  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.63 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0775  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.37 
 
 		 451 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344543  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2627  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.46 
 
 		 489 aa  239  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0195  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.87 
 
 		 453 aa  239  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 		 462 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0996  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.14 
 
 		 501 aa  237  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0354541  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1212  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 		 446 aa  236  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 		 477 aa  236  8e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0113  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  37.2 
 
 		 476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0625  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.46 
 
 		 453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1540  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.809941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1177  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 		 486 aa  234  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0494715  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0528  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 		 498 aa  233  4.0000000000000004e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.633345  unclonable  0.0000000475164 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.37 
 
 		 457 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.275384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46230  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.6 
 
 		 452 aa  233  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4654  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.89 
 
 		 453 aa  233  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3577  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.89 
 
 		 453 aa  233  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  0.771098 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6179  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.74 
 
 		 458 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2602  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.81 
 
 		 461 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0174  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.440374  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0295  nicotinate phosphoribosyltransferase  35 
 
 		 486 aa  230  4e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0255  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.81 
 
 		 456 aa  230  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1417  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.23 
 
 		 490 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1227  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 		 490 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.507813  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1215  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 451 aa  228  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0281  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.81 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.168647  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1011  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.15 
 
 		 468 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3836  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0322574  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2987  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.59 
 
 		 479 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.87 
 
 		 468 aa  226  8e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0890  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 		 475 aa  226  9e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.17 
 
 		 480 aa  226  9e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4911  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 		 489 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489735  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0227  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.54 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1450  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.49 
 
 		 489 aa  224  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.532365  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0322  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.39 
 
 		 467 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2057  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.2 
 
 		 445 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134189  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2003  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.46 
 
 		 489 aa  223  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.675811  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1969  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.46 
 
 		 489 aa  223  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.411515  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0827  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.09 
 
 		 460 aa  223  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>