54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1566 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1566  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  336  8e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0865  hypothetical protein  43.79 
 
 
158 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0837  hypothetical protein  43.79 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2505  hypothetical protein  30.71 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  27.43 
 
 
184 aa  53.9  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  26.55 
 
 
184 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  24.31 
 
 
184 aa  51.6  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  23.61 
 
 
184 aa  51.2  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  26.61 
 
 
185 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0341  protein of unknown function DUF820  28.06 
 
 
192 aa  48.5  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000574884  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  30.43 
 
 
183 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0553  hypothetical protein  22 
 
 
213 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  27.63 
 
 
191 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6321  hypothetical protein  29.76 
 
 
172 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469279  normal  0.910042 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  45.95 
 
 
182 aa  44.7  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  47.22 
 
 
184 aa  44.3  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  26.32 
 
 
197 aa  44.3  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  38.89 
 
 
197 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  32.56 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4062  hypothetical protein  26.63 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.654583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2702  protein of unknown function DUF820  26.95 
 
 
191 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993643  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  32.74 
 
 
153 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  38.89 
 
 
197 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  38.89 
 
 
200 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  32.65 
 
 
187 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2373  protein of unknown function DUF820  26.76 
 
 
193 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  36 
 
 
188 aa  42  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  50 
 
 
248 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  40.54 
 
 
180 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  50 
 
 
248 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0099  protein of unknown function DUF820  28.95 
 
 
194 aa  41.2  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2463  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
185 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0607621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3375  hypothetical protein  32 
 
 
245 aa  41.2  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2886  protein of unknown function DUF820  27.97 
 
 
184 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  45.95 
 
 
195 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  35.48 
 
 
209 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  37.1 
 
 
187 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  34.33 
 
 
265 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  36.67 
 
 
250 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  36.67 
 
 
250 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2438  protein of unknown function DUF820  24.24 
 
 
187 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.873691  normal  0.192917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2387  protein of unknown function DUF820  24.24 
 
 
187 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0267  protein of unknown function DUF820  27.78 
 
 
200 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  39.58 
 
 
241 aa  40.8  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  31.94 
 
 
189 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3372  hypothetical protein  32 
 
 
259 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0267  protein of unknown function DUF820  28.17 
 
 
200 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  32.43 
 
 
186 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  38 
 
 
217 aa  40.8  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3374  hypothetical protein  32 
 
 
259 aa  40.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3373  hypothetical protein  32 
 
 
245 aa  40.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0255  protein of unknown function DUF820  44.44 
 
 
165 aa  40.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  38 
 
 
230 aa  40.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>