30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0622 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0622  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4459  hypothetical protein  33.18 
 
 
289 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59130  hypothetical protein  33.18 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000119768  hitchhiker  0.00578423 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1661  hypothetical protein  31.46 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0357337  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2818  hypothetical protein  32.39 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.326931  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0475  hypothetical protein  31.92 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1524  hypothetical protein  34.93 
 
 
259 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0993  hypothetical protein  30.63 
 
 
262 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2339  hypothetical protein  30.77 
 
 
262 aa  105  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4147  hypothetical protein  29.11 
 
 
266 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119545  hitchhiker  0.00139206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2236  hypothetical protein  30.52 
 
 
259 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2295  hypothetical protein  29.58 
 
 
263 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000011125  hitchhiker  0.000111621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3382  hypothetical protein  29.58 
 
 
262 aa  102  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0754853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1448  hypothetical protein  28.9 
 
 
264 aa  99  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0430118  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1314  hypothetical protein  28.9 
 
 
264 aa  99  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.252926 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0641  hypothetical protein  28.85 
 
 
259 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.593076  normal  0.0266858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1226  hypothetical protein  28.31 
 
 
259 aa  98.6  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0562  hypothetical protein  28.89 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3290  hypothetical protein  30.22 
 
 
251 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2918  hypothetical protein  30.29 
 
 
251 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497649  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2998  hypothetical protein  27.23 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00986967  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3944  hypothetical protein  27.92 
 
 
269 aa  82  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00955657  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1724  hypothetical protein  27.93 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.59027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0308  hypothetical protein  25.71 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000403318 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4109  hypothetical protein  26.27 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.930656  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0617  hypothetical protein  25.68 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4410  hypothetical protein  24.88 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2682  hypothetical protein  29.63 
 
 
375 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.122486 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3742  hypothetical protein  22.97 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2801  hypothetical protein  23.59 
 
 
246 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>