14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2682 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2682  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  766    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122486 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0622  hypothetical protein  29.63 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1524  hypothetical protein  23.44 
 
 		 259 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4109  hypothetical protein  28.95 
 
 		 253 aa  50.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.930656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59130  hypothetical protein  25 
 
 		 242 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000119768  hitchhiker  0.00578423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3290  hypothetical protein  29.69 
 
 		 251 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2918  hypothetical protein  29.69 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4459  hypothetical protein  25.93 
 
 		 289 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2998  hypothetical protein  27.21 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00986967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3944  hypothetical protein  21.6 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00955657  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1724  hypothetical protein  27.2 
 
 		 250 aa  44.3  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.59027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4147  hypothetical protein  23.19 
 
 		 266 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119545  hitchhiker  0.00139206 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1226  hypothetical protein  23.05 
 
 		 259 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2818  hypothetical protein  27.42 
 
 		 262 aa  42.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.326931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>