30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4147 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4147  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  544  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119545  hitchhiker  0.00139206 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1226  hypothetical protein  90.59 
 
 
259 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3382  hypothetical protein  87.59 
 
 
262 aa  454  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0754853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2295  hypothetical protein  87.27 
 
 
263 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000011125  hitchhiker  0.000111621 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1314  hypothetical protein  87.92 
 
 
264 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.252926 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1448  hypothetical protein  87.92 
 
 
264 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0430118  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0641  hypothetical protein  88.29 
 
 
259 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.593076  normal  0.0266858 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2818  hypothetical protein  78.65 
 
 
262 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.326931  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0993  hypothetical protein  83.67 
 
 
262 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0562  hypothetical protein  78.71 
 
 
277 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2236  hypothetical protein  83.67 
 
 
259 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1661  hypothetical protein  75.28 
 
 
272 aa  391  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0357337  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2339  hypothetical protein  88.24 
 
 
262 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0475  hypothetical protein  76.59 
 
 
272 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3290  hypothetical protein  50.82 
 
 
251 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2918  hypothetical protein  50.81 
 
 
251 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497649  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59130  hypothetical protein  54.05 
 
 
242 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000119768  hitchhiker  0.00578423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4459  hypothetical protein  53.6 
 
 
289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1524  hypothetical protein  52.07 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2998  hypothetical protein  54.84 
 
 
272 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00986967  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1724  hypothetical protein  34.86 
 
 
250 aa  155  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.59027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4109  hypothetical protein  32 
 
 
253 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.930656  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0617  hypothetical protein  31.19 
 
 
250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0308  hypothetical protein  33.18 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000403318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3742  hypothetical protein  30.09 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4410  hypothetical protein  31.02 
 
 
215 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3944  hypothetical protein  30.84 
 
 
269 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00955657  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0622  hypothetical protein  29.11 
 
 
247 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2801  hypothetical protein  20 
 
 
246 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2682  hypothetical protein  23.19 
 
 
375 aa  45.4  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.122486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>