30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2998 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2998  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00986967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3290  hypothetical protein  70.28 
 
 		 251 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2918  hypothetical protein  69.72 
 
 		 251 aa  341  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0641  hypothetical protein  57.6 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.593076  normal  0.0266858 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1661  hypothetical protein  55.7 
 
 		 272 aa  265  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0357337  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0475  hypothetical protein  55.7 
 
 		 272 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2818  hypothetical protein  53.66 
 
 		 262 aa  262  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.326931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4147  hypothetical protein  54.84 
 
 		 266 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119545  hitchhiker  0.00139206 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0562  hypothetical protein  55.17 
 
 		 277 aa  259  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1226  hypothetical protein  52 
 
 		 259 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2295  hypothetical protein  53.62 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000011125  hitchhiker  0.000111621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3382  hypothetical protein  54.59 
 
 		 262 aa  256  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0754853 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2339  hypothetical protein  55.36 
 
 		 262 aa  255  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0993  hypothetical protein  54.91 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1448  hypothetical protein  55.16 
 
 		 264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0430118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1314  hypothetical protein  55.16 
 
 		 264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4459  hypothetical protein  55.7 
 
 		 289 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59130  hypothetical protein  56.25 
 
 		 242 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000119768  hitchhiker  0.00578423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2236  hypothetical protein  55.76 
 
 		 259 aa  248  9e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1524  hypothetical protein  47.91 
 
 		 259 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1724  hypothetical protein  35.71 
 
 		 250 aa  153  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.59027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4109  hypothetical protein  33.18 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.930656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3742  hypothetical protein  31.08 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3944  hypothetical protein  36.57 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00955657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0308  hypothetical protein  31.78 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000403318 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4410  hypothetical protein  29.77 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0617  hypothetical protein  32.11 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0622  hypothetical protein  27.4 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2682  hypothetical protein  27.21 
 
 		 375 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122486 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2801  hypothetical protein  25.35 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>