28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0617 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0617  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3742  hypothetical protein  55.1 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4109  hypothetical protein  45.29 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.930656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0308  hypothetical protein  46.64 
 
 		 247 aa  211  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000403318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4147  hypothetical protein  31.19 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119545  hitchhiker  0.00139206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0641  hypothetical protein  30.28 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.593076  normal  0.0266858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2236  hypothetical protein  31.19 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3382  hypothetical protein  30.73 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0754853 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2818  hypothetical protein  31.53 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.326931  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2295  hypothetical protein  30.73 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000011125  hitchhiker  0.000111621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0993  hypothetical protein  31.19 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2918  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1314  hypothetical protein  30.73 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252926 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1448  hypothetical protein  30.73 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0430118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1226  hypothetical protein  30.25 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2339  hypothetical protein  30.73 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0562  hypothetical protein  30.28 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3290  hypothetical protein  32.57 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59130  hypothetical protein  29.57 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000119768  hitchhiker  0.00578423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2998  hypothetical protein  32.11 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00986967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1661  hypothetical protein  31.08 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0357337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4459  hypothetical protein  29.57 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1524  hypothetical protein  27.8 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0475  hypothetical protein  29.82 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1724  hypothetical protein  30.7 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.59027  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3944  hypothetical protein  29.44 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00955657  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4410  hypothetical protein  26.2 
 
 		 215 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0622  hypothetical protein  25.68 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>