32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1623 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1623  DNA-binding TFAR19-related protein  100 
 
 
93 aa  189  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0455  hypothetical protein  44.58 
 
 
122 aa  77  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258882  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1326  DNA-binding TFAR19-related protein  56 
 
 
118 aa  77  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1625  hypothetical protein  50.67 
 
 
117 aa  73.6  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000273168  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0441  hypothetical protein  47.3 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3016  hypothetical protein  52.05 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1791  hypothetical protein  45.95 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0495408 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1679  hypothetical protein  47.3 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0998  hypothetical protein  47.44 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1571  hypothetical protein  46.58 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1972  hypothetical protein  46.58 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0203  DNA-binding TFAR19-related protein  42.25 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.74773  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1482  hypothetical protein  44.93 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000000592123  hitchhiker  0.00048163 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0025  DNA-binding TFAR19-related protein  47.37 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1300  DNA-binding TFAR19-related protein  37.84 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.653558  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2216  hypothetical protein  36.78 
 
 
117 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.177164 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1886  hypothetical protein  40.26 
 
 
112 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0471  DNA-binding TFAR19-related protein  47.3 
 
 
116 aa  60.8  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1982  hypothetical protein  34.09 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1517  DNA-binding TFAR19-related protein  35.37 
 
 
116 aa  60.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.811536  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0987  hypothetical protein  41.18 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3486  DNA-binding TFAR19-related protein  39.71 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0536  hypothetical protein  47.76 
 
 
109 aa  57  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.000000985959  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1162  hypothetical protein  47.37 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0793  hypothetical protein  49.12 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.266993  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1518  hypothetical protein  47.37 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.40908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1157  hypothetical protein  47.37 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01260  conserved hypothetical protein  42.11 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.0000143671  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33400  predicted protein  44.44 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000544709  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0117  hypothetical protein  35.71 
 
 
114 aa  49.7  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04758  dsDNA-binding protein PDCD5, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06420)  43.33 
 
 
143 aa  47  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47586  predicted protein  37.74 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>