32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1625 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1625  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  225  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000273168  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1326  DNA-binding TFAR19-related protein  72.81 
 
 		 118 aa  169  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0203  DNA-binding TFAR19-related protein  63.38 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.74773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0441  hypothetical protein  48.65 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1679  hypothetical protein  47.46 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1791  hypothetical protein  45.05 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0495408 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0471  DNA-binding TFAR19-related protein  50.86 
 
 		 116 aa  87.4  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0025  DNA-binding TFAR19-related protein  50 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0998  hypothetical protein  50.62 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1571  hypothetical protein  59.15 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0987  hypothetical protein  43.27 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0455  hypothetical protein  52.7 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1972  hypothetical protein  48.78 
 
 		 112 aa  76.6  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1623  DNA-binding TFAR19-related protein  50.67 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1482  hypothetical protein  48.53 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000000592123  hitchhiker  0.00048163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1886  hypothetical protein  39.09 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1982  hypothetical protein  42.74 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3016  hypothetical protein  49.32 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0536  hypothetical protein  42.06 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.000000985959  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1300  DNA-binding TFAR19-related protein  46.25 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.653558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1162  hypothetical protein  52.31 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1517  DNA-binding TFAR19-related protein  38.89 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.811536  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3486  DNA-binding TFAR19-related protein  38.61 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0793  hypothetical protein  49.23 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.266993  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0117  hypothetical protein  47.62 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1157  hypothetical protein  47.69 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1518  hypothetical protein  51.67 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.40908  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04758  dsDNA-binding protein PDCD5, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06420)  37.93 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2216  hypothetical protein  35.35 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.177164 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01260  conserved hypothetical protein  40.98 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.0000143671  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47586  predicted protein  38.67 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33400  predicted protein  37.04 
 
 		 133 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000544709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>