28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2216 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2216  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  225  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.177164 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1300  DNA-binding TFAR19-related protein  63.25 
 
 		 116 aa  143  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.653558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3486  DNA-binding TFAR19-related protein  58.82 
 
 		 115 aa  136  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1517  DNA-binding TFAR19-related protein  58.33 
 
 		 116 aa  134  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.811536  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1982  hypothetical protein  56.3 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0455  hypothetical protein  37.39 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1886  hypothetical protein  38.74 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1571  hypothetical protein  41.44 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3016  hypothetical protein  44 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0536  hypothetical protein  39.64 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.000000985959  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1482  hypothetical protein  44.93 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000000592123  hitchhiker  0.00048163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1972  hypothetical protein  41.77 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1326  DNA-binding TFAR19-related protein  38.6 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1679  hypothetical protein  40.21 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1623  DNA-binding TFAR19-related protein  36.78 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1791  hypothetical protein  38.14 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0495408 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0998  hypothetical protein  37 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0441  hypothetical protein  37.11 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0117  hypothetical protein  33.64 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1625  hypothetical protein  35.35 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000273168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0025  DNA-binding TFAR19-related protein  34 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1157  hypothetical protein  31.03 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1162  hypothetical protein  33.7 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0987  hypothetical protein  36.08 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0203  DNA-binding TFAR19-related protein  37.7 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.74773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0793  hypothetical protein  30.43 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.266993  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0471  DNA-binding TFAR19-related protein  29.06 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1518  hypothetical protein  29.57 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.40908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>