28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_47586 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_47586  predicted protein  100 
 
 
131 aa  258  2e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04758  dsDNA-binding protein PDCD5, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06420)  32.58 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0025  DNA-binding TFAR19-related protein  36 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1300  DNA-binding TFAR19-related protein  30.77 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.653558  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01260  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.0000143671  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1791  hypothetical protein  30.56 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0495408 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0117  hypothetical protein  33.06 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1679  hypothetical protein  32.35 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0455  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258882  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0441  hypothetical protein  32.04 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0536  hypothetical protein  43.08 
 
 
109 aa  50.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.000000985959  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1482  hypothetical protein  41.38 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000000592123  hitchhiker  0.00048163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3016  hypothetical protein  34.69 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1972  hypothetical protein  30.77 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1625  hypothetical protein  33.7 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000273168  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3486  DNA-binding TFAR19-related protein  27.18 
 
 
115 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1326  DNA-binding TFAR19-related protein  27.1 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1982  hypothetical protein  29.13 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1886  hypothetical protein  39.68 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1571  hypothetical protein  33.67 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1623  DNA-binding TFAR19-related protein  34.25 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2216  hypothetical protein  31.07 
 
 
117 aa  43.5  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.177164 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0998  hypothetical protein  28.07 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33400  predicted protein  32.31 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000544709  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1517  DNA-binding TFAR19-related protein  25 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.811536  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0793  hypothetical protein  32.88 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.266993  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1157  hypothetical protein  32.88 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0987  hypothetical protein  29.47 
 
 
108 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>