32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0203 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0203  DNA-binding TFAR19-related protein  100 
 
 
116 aa  219  8e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.74773  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0441  hypothetical protein  65.35 
 
 
110 aa  128  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1326  DNA-binding TFAR19-related protein  58.72 
 
 
118 aa  125  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1791  hypothetical protein  60.55 
 
 
110 aa  125  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0495408 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1679  hypothetical protein  59.41 
 
 
110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0987  hypothetical protein  64.36 
 
 
108 aa  116  9e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1625  hypothetical protein  58.25 
 
 
117 aa  114  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000273168  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0471  DNA-binding TFAR19-related protein  52.85 
 
 
116 aa  95.1  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0025  DNA-binding TFAR19-related protein  53.47 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1571  hypothetical protein  47.27 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0455  hypothetical protein  44.04 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258882  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0998  hypothetical protein  37.86 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3486  DNA-binding TFAR19-related protein  42.71 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1517  DNA-binding TFAR19-related protein  41.24 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.811536  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3016  hypothetical protein  44.34 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1982  hypothetical protein  42.11 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1300  DNA-binding TFAR19-related protein  42.31 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.653558  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1518  hypothetical protein  41.35 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.40908  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1162  hypothetical protein  42.06 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0536  hypothetical protein  45.74 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.000000985959  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0793  hypothetical protein  41 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.266993  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1972  hypothetical protein  45.12 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1157  hypothetical protein  40.59 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0117  hypothetical protein  38.94 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1886  hypothetical protein  40.74 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1623  DNA-binding TFAR19-related protein  42.47 
 
 
93 aa  67  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1482  hypothetical protein  44.93 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000000592123  hitchhiker  0.00048163 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04758  dsDNA-binding protein PDCD5, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06420)  39.47 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2216  hypothetical protein  36.73 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.177164 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01260  conserved hypothetical protein  38.33 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.0000143671  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47586  predicted protein  28.42 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33400  predicted protein  38 
 
 
133 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000544709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>