78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3880 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3880  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  296  6e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0181  protein of unknown function DUF937  56.41 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.751703 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1884  hypothetical protein  54.94 
 
 		 163 aa  144  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1214  hypothetical protein  58.97 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5655  hypothetical protein  50.97 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7942  protein of unknown function DUF937  61.94 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0305  protein of unknown function DUF937  53.75 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1050  protein of unknown function DUF937  55.13 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.251425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2216  hypothetical protein  43.87 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3775  hypothetical protein  56.29 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0871445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1957  protein of unknown function DUF937  47.33 
 
 		 177 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0191237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0722  protein of unknown function DUF937  48 
 
 		 177 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.888742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4857  hypothetical protein  48.32 
 
 		 161 aa  98.2  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0246894 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0511  hypothetical protein  53.57 
 
 		 193 aa  91.3  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0555  hypothetical protein  51.19 
 
 		 192 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0478  protein of unknown function DUF937  52.38 
 
 		 186 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.256572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0455  hypothetical protein  49.43 
 
 		 192 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7531  hypothetical protein  50.57 
 
 		 198 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0267  hypothetical protein  49.43 
 
 		 206 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0562  hypothetical protein  51.72 
 
 		 201 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0601987  normal  0.0329184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6724  protein of unknown function DUF937  46.91 
 
 		 222 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4535  protein of unknown function DUF937  39.37 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4423  protein of unknown function DUF937  35.16 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6527  hypothetical protein  43.37 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581879  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4053  hypothetical protein  37.8 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.233795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0112  hypothetical protein  37.8 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00850654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3772  protein of unknown function DUF937  41.75 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1900  hypothetical protein  41.33 
 
 		 234 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3664  protein of unknown function DUF937  44.44 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0283759  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2062  hypothetical protein  42.17 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7138  protein of unknown function DUF937  35.29 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00491269  normal  0.388289 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1814  protein of unknown function DUF937  38.75 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147031 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0199  hypothetical protein  43.42 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2744  hypothetical protein  39.47 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000751209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0434  hypothetical protein  42.31 
 
 		 183 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2373  hypothetical protein  36.25 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117138  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0545  hypothetical protein  41.03 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2206  hypothetical protein  38.75 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2429  hypothetical protein  34.57 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1654  hypothetical protein  32.06 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469031  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1427  hypothetical protein  36.25 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.874769  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1866  hypothetical protein  37.5 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6233  hypothetical protein  36.25 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1846  hypothetical protein  36.25 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1870  hypothetical protein  36.25 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.951704  hitchhiker  0.000304239 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0031  hypothetical protein  37.5 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.48544  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1376  hypothetical protein  37.5 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.40321  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1137  hypothetical protein  37.5 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2683  protein of unknown function DUF937  29.73 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5279  protein of unknown function DUF937  32.47 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0939  hypothetical protein  35 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933018  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5147  hypothetical protein  38.75 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.670787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0441  hypothetical protein  41.56 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3855  hypothetical protein  38.27 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1756  hypothetical protein  36.25 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1784  hypothetical protein  36.25 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1730  protein of unknown function DUF937  32.38 
 
 		 210 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.6083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2764  hypothetical protein  35.37 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.465593 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3368  protein of unknown function DUF937  30.91 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2166  protein of unknown function DUF937  35.9 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2844  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2528  hypothetical protein  30 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1992  protein of unknown function DUF937  37.33 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3060  hypothetical protein  30.38 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1319  hypothetical protein  36 
 
 		 194 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2984  hypothetical protein  35.06 
 
 		 209 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14975  hypothetical protein  36 
 
 		 195 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.259264 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2217  protein of unknown function DUF937  35.9 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2092  hypothetical protein  32.1 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2353  hypothetical protein  30.77 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2271  hypothetical protein  27.72 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0577348  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0738  hypothetical protein  28 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3003  protein of unknown function DUF937  32.14 
 
 		 199 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2593  protein of unknown function DUF937  30.95 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2388  hypothetical protein  36.25 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2222  hypothetical protein  36.25 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2260  hypothetical protein  36.25 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4063  hypothetical protein  28.75 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>