83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0722 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0722  protein of unknown function DUF937  100 
 
 
177 aa  340  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.888742  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1957  protein of unknown function DUF937  86.44 
 
 
177 aa  241  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0191237  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3880  hypothetical protein  49.34 
 
 
153 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0181  protein of unknown function DUF937  49.33 
 
 
157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.751703 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7942  protein of unknown function DUF937  50.72 
 
 
157 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7531  hypothetical protein  55.68 
 
 
198 aa  104  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0555  hypothetical protein  56.82 
 
 
192 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0305  protein of unknown function DUF937  44.76 
 
 
157 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2216  hypothetical protein  35.44 
 
 
163 aa  101  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1050  protein of unknown function DUF937  42.38 
 
 
157 aa  100  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.251425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5655  hypothetical protein  41.18 
 
 
158 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1214  hypothetical protein  51.69 
 
 
157 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1884  hypothetical protein  52.33 
 
 
163 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0267  hypothetical protein  55.68 
 
 
206 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0511  hypothetical protein  52.27 
 
 
193 aa  94  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4857  hypothetical protein  39.04 
 
 
161 aa  92.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0246894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3775  hypothetical protein  55.56 
 
 
153 aa  92  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0871445  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0562  hypothetical protein  54.55 
 
 
201 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0601987  normal  0.0329184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0478  protein of unknown function DUF937  51.14 
 
 
186 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.256572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0455  hypothetical protein  48.86 
 
 
192 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4535  protein of unknown function DUF937  44.94 
 
 
225 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0112  hypothetical protein  43.64 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00850654  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4423  protein of unknown function DUF937  43.82 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4053  hypothetical protein  43.82 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6724  protein of unknown function DUF937  45.24 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1900  hypothetical protein  43.04 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3664  protein of unknown function DUF937  43.9 
 
 
133 aa  72  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0283759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3855  hypothetical protein  46.34 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.901  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6527  hypothetical protein  42.35 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581879  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3772  protein of unknown function DUF937  43.9 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7138  protein of unknown function DUF937  33.98 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00491269  normal  0.388289 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0199  hypothetical protein  48.65 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0545  hypothetical protein  47.3 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0434  hypothetical protein  45.95 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0939  hypothetical protein  41.46 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933018  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2744  hypothetical protein  41.33 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000751209  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2429  hypothetical protein  35.37 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1654  hypothetical protein  36.63 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469031  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5279  protein of unknown function DUF937  41.33 
 
 
154 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1814  protein of unknown function DUF937  38.27 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.147031 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2764  hypothetical protein  39.29 
 
 
187 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.465593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2062  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2373  hypothetical protein  37.04 
 
 
142 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117138  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1730  protein of unknown function DUF937  34.02 
 
 
210 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.6083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2844  hypothetical protein  37.33 
 
 
202 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2984  hypothetical protein  37.97 
 
 
209 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1376  hypothetical protein  37.04 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.40321  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1866  hypothetical protein  37.04 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1137  hypothetical protein  37.04 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2206  hypothetical protein  37.04 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101449  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0031  hypothetical protein  37.04 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.48544  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0738  hypothetical protein  31.58 
 
 
150 aa  55.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2528  hypothetical protein  27.12 
 
 
131 aa  54.7  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0441  hypothetical protein  35.77 
 
 
154 aa  54.7  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3060  hypothetical protein  31.48 
 
 
129 aa  54.3  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2683  protein of unknown function DUF937  32.74 
 
 
116 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237032  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6233  hypothetical protein  34.94 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1846  hypothetical protein  34.94 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1870  hypothetical protein  34.94 
 
 
142 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.951704  hitchhiker  0.000304239 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5147  hypothetical protein  36.59 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.670787  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1784  hypothetical protein  35.8 
 
 
143 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1756  hypothetical protein  35.8 
 
 
143 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1427  hypothetical protein  35.8 
 
 
143 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.874769  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3368  protein of unknown function DUF937  36.17 
 
 
119 aa  51.2  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1319  hypothetical protein  32.1 
 
 
194 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14975  hypothetical protein  30.86 
 
 
195 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.259264 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2092  hypothetical protein  32.18 
 
 
138 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03525  hypothetical protein  32.61 
 
 
132 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.998118  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3910  hypothetical protein  32.61 
 
 
132 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0005  hypothetical protein  32.61 
 
 
132 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4207  hypothetical protein  32.61 
 
 
132 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03581  hypothetical protein  32.61 
 
 
132 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0005  protein of unknown function DUF937  32.61 
 
 
132 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2271  hypothetical protein  29.36 
 
 
113 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0577348  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5126  hypothetical protein  32.61 
 
 
132 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.20781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4063  hypothetical protein  32.61 
 
 
132 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2353  hypothetical protein  31.13 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4227  hypothetical protein  31.52 
 
 
132 aa  45.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2166  protein of unknown function DUF937  33.68 
 
 
146 aa  45.1  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1734  hypothetical protein  29.73 
 
 
182 aa  44.7  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1984  hypothetical protein  29.52 
 
 
115 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3003  protein of unknown function DUF937  36.21 
 
 
199 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2273  hypothetical protein  26.97 
 
 
130 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136761  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>