84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1884 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1884  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  313  8e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0181  protein of unknown function DUF937  81.6 
 
 		 157 aa  224  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.751703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0305  protein of unknown function DUF937  81.6 
 
 		 157 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1214  hypothetical protein  77.3 
 
 		 157 aa  208  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7942  protein of unknown function DUF937  72.39 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3880  hypothetical protein  58.64 
 
 		 153 aa  170  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5655  hypothetical protein  56.36 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1050  protein of unknown function DUF937  56.44 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.251425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3775  hypothetical protein  66.26 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0871445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2216  hypothetical protein  43.31 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1957  protein of unknown function DUF937  43.4 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0191237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0722  protein of unknown function DUF937  46.79 
 
 		 177 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.888742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0555  hypothetical protein  55.29 
 
 		 192 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0511  hypothetical protein  54.12 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0267  hypothetical protein  43.04 
 
 		 206 aa  94.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0562  hypothetical protein  51.76 
 
 		 201 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0601987  normal  0.0329184 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4857  hypothetical protein  38.89 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0246894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0478  protein of unknown function DUF937  49.41 
 
 		 186 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.256572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0455  hypothetical protein  48.24 
 
 		 192 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7531  hypothetical protein  50.59 
 
 		 198 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1900  hypothetical protein  48 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169286 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4535  protein of unknown function DUF937  44.44 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4423  protein of unknown function DUF937  43.68 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4053  hypothetical protein  43.68 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.233795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6724  protein of unknown function DUF937  45.12 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2062  hypothetical protein  42.68 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6527  hypothetical protein  43.96 
 
 		 217 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581879  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0112  hypothetical protein  38.89 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00850654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3772  protein of unknown function DUF937  37.5 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3664  protein of unknown function DUF937  32.14 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0283759  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1814  protein of unknown function DUF937  37.5 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2373  hypothetical protein  36.36 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117138  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1427  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.874769  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1870  hypothetical protein  36.36 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.951704  hitchhiker  0.000304239 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1846  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6233  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2429  hypothetical protein  35 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5279  protein of unknown function DUF937  38.67 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1137  hypothetical protein  34.09 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0545  hypothetical protein  41.89 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1376  hypothetical protein  34.09 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.40321  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1866  hypothetical protein  34.09 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0031  hypothetical protein  34.09 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.48544  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0939  hypothetical protein  34.09 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933018  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5147  hypothetical protein  35.23 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.670787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1654  hypothetical protein  34.31 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469031  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2206  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101449  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1756  hypothetical protein  35.23 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7138  protein of unknown function DUF937  32.5 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00491269  normal  0.388289 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1784  hypothetical protein  35.23 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2166  protein of unknown function DUF937  33.64 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3855  hypothetical protein  35 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2683  protein of unknown function DUF937  29.63 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2744  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000751209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0434  hypothetical protein  39.19 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2844  hypothetical protein  40.79 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1730  protein of unknown function DUF937  32.1 
 
 		 210 aa  57.4  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.6083 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0199  hypothetical protein  35.14 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14975  hypothetical protein  34.67 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.259264 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0441  hypothetical protein  37.84 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1319  hypothetical protein  36 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2271  hypothetical protein  26.92 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0577348  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3060  hypothetical protein  30.38 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3368  protein of unknown function DUF937  33.33 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4227  hypothetical protein  31.71 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2353  hypothetical protein  29 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03525  hypothetical protein  32.1 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.998118  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3910  hypothetical protein  32.1 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4063  hypothetical protein  32.93 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0005  hypothetical protein  32.1 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4207  hypothetical protein  32.1 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03581  hypothetical protein  32.1 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0005  protein of unknown function DUF937  32.1 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2764  hypothetical protein  32.1 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.465593 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2528  hypothetical protein  26.32 
 
 		 131 aa  48.5  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2092  hypothetical protein  35.44 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0738  hypothetical protein  23.68 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2260  hypothetical protein  34.09 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786219  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2222  hypothetical protein  34.09 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2388  hypothetical protein  34.09 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5126  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.20781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2217  protein of unknown function DUF937  26.92 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0539  hypothetical protein  30 
 
 		 229 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154515  unclonable  0.00000000103423 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1992  protein of unknown function DUF937  26.47 
 
 		 146 aa  42  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>