10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3865 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4392    100 
 
 		 1526 bp  747    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3865    100 
 
 		 1121 bp  2222    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0681623  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  84.35 
 
 		 1497 bp  450  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3945  transposase  98.95 
 
 		 438 bp  363  7e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2774  transposase  98.43 
 
 		 417 bp  355  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.648281  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  80.56 
 
 		 1494 bp  268  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5139  hypothetical protein  80.4 
 
 		 1407 bp  260  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235994  normal  0.315254 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4650    97.81 
 
 		 282 bp  248  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  80.07 
 
 		 1509 bp  244  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8292  IS21 family transposase  82.96 
 
 		 612 bp  85.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>