9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4650 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4650    100 
 
 		 282 bp  559  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3865    97.81 
 
 		 1121 bp  248  6.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0681623  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4392    100 
 
 		 1526 bp  97.6  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  83.61 
 
 		 1497 bp  83.8  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5139  hypothetical protein  81.95 
 
 		 1407 bp  73.8  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235994  normal  0.315254 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  81.95 
 
 		 1494 bp  73.8  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3955  transposase IS116/IS110/IS902  96.55 
 
 		 1029 bp  50.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  81.19 
 
 		 1509 bp  50.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0808  transposase IS116/IS110/IS902  93.55 
 
 		 1029 bp  46.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>