12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4392 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4392    100 
 
 		 1526 bp  3025    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3865    100 
 
 		 1121 bp  747    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0681623  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3945  transposase  98.93 
 
 		 438 bp  708    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  87.05 
 
 		 1497 bp  745    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2774  transposase  98.53 
 
 		 417 bp  632  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.648281  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  82.07 
 
 		 1509 bp  325  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  81.9 
 
 		 1494 bp  317  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5139  hypothetical protein  82.16 
 
 		 1407 bp  242  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235994  normal  0.315254 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8292  IS21 family transposase  82.85 
 
 		 612 bp  214  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256876  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3970  hypothetical protein  96.72 
 
 		 528 bp  105  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4650    100 
 
 		 282 bp  97.6  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1653  hypothetical protein  100 
 
 		 372 bp  48.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>