40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0758 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0758    100 
 
 		 595 bp  1179    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5307  isochorismatase hydrolase  84.3 
 
 		 630 bp  178  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5248  isochorismatase superfamily hydrolase  85.32 
 
 		 630 bp  178  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5158  isochorismatase hydrolase  84.86 
 
 		 630 bp  170  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283846  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2888  isochorismatase hydrolase  82.65 
 
 		 627 bp  163  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724068  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5303  isochorismatase hydrolase  83.94 
 
 		 630 bp  155  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31440  hydrolase, isochorismatase family  82.16 
 
 		 648 bp  153  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4761  isochorismatase hydrolase  82.31 
 
 		 627 bp  151  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4472  isochorismatase hydrolase  82.97 
 
 		 621 bp  145  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5165  isochorismatase hydrolase  82.23 
 
 		 630 bp  139  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0378117  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0218  isochorismatase hydrolase  82.53 
 
 		 630 bp  137  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0745  isochorismatase hydrolase  84.04 
 
 		 621 bp  135  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3570  isochorismatase hydrolase  84.36 
 
 		 615 bp  133  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411732  normal  0.268452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5255  isochorismatase superfamily hydrolase  82.57 
 
 		 630 bp  131  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0229  isochorismatase hydrolase  84.39 
 
 		 627 bp  129  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0711  isochorismatase superfamily hydrolase  83.51 
 
 		 621 bp  127  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.175294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0480  isochorismatase hydrolase  82.02 
 
 		 648 bp  127  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702757  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1009  isochorismatase family protein  84.12 
 
 		 627 bp  123  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0749  isochorismatase hydrolase  82.67 
 
 		 621 bp  123  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2298  isochorismatase hydrolase  83.82 
 
 		 633 bp  121  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5153  isochorismatase hydrolase  86.89 
 
 		 627 bp  115  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48760  putative hydrolase  87.61 
 
 		 618 bp  113  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4176  putative hydrolase  87.61 
 
 		 618 bp  113  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  86.07 
 
 		 624 bp  107  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5243  isochorismatase superfamily hydrolase  85.25 
 
 		 627 bp  99.6  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2583  isochorismatase family protein  82.08 
 
 		 633 bp  97.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1001  isochorismatase hydrolase  81.62 
 
 		 627 bp  97.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3987  isochorismatase hydrolase  79.48 
 
 		 627 bp  81.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1779  isochorismatase hydrolase  78.79 
 
 		 627 bp  69.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1967  isochorismatase hydrolase  83.18 
 
 		 627 bp  69.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00908  hypothetical protein  79.13 
 
 		 627 bp  67.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00901  predicted hydrolase  79.13 
 
 		 627 bp  67.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.460516  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2699  isochorismatase hydrolase  79.13 
 
 		 627 bp  67.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1002    79.13 
 
 		 627 bp  67.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.698003  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2746  isochorismatase hydrolase  79.13 
 
 		 627 bp  67.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0051    82.69 
 
 		 624 bp  63.9  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2223  isochorismatase family protein  79.64 
 
 		 627 bp  61.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665514 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0973  isochorismatase hydrolase family protein  78.64 
 
 		 627 bp  60  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1059  isochorismatase family protein  78.64 
 
 		 627 bp  60  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0070  isochorismatase hydrolase  92.68 
 
 		 414 bp  58  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>