34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0051 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0051    100 
 
 
624 bp  1237    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4176  putative hydrolase  83.09 
 
 
618 bp  307  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48760  putative hydrolase  85.13 
 
 
618 bp  276  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3570  isochorismatase hydrolase  83.56 
 
 
615 bp  248  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411732  normal  0.268452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4472  isochorismatase hydrolase  82.82 
 
 
621 bp  202  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5303  isochorismatase hydrolase  83.75 
 
 
630 bp  192  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.793467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1779  isochorismatase hydrolase  79.45 
 
 
627 bp  192  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2298  isochorismatase hydrolase  80.22 
 
 
633 bp  188  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155249  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5158  isochorismatase hydrolase  84.62 
 
 
630 bp  178  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283846  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3987  isochorismatase hydrolase  86.49 
 
 
627 bp  168  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5307  isochorismatase hydrolase  82.9 
 
 
630 bp  168  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.308545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5248  isochorismatase superfamily hydrolase  84.07 
 
 
630 bp  163  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5153  isochorismatase hydrolase  83.06 
 
 
627 bp  159  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5165  isochorismatase hydrolase  83.13 
 
 
630 bp  157  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0378117  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5243  isochorismatase superfamily hydrolase  82.8 
 
 
627 bp  155  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0218  isochorismatase hydrolase  80.65 
 
 
630 bp  151  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5255  isochorismatase superfamily hydrolase  82.72 
 
 
630 bp  149  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1967  isochorismatase hydrolase  82.19 
 
 
627 bp  141  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2888  isochorismatase hydrolase  79.35 
 
 
627 bp  139  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724068  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0749  isochorismatase hydrolase  83.77 
 
 
621 bp  133  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0229  isochorismatase hydrolase  81.63 
 
 
627 bp  129  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2583  isochorismatase family protein  86.86 
 
 
633 bp  129  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31440  hydrolase, isochorismatase family  81.7 
 
 
648 bp  119  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4761  isochorismatase hydrolase  80.3 
 
 
627 bp  113  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0745  isochorismatase hydrolase  82.2 
 
 
621 bp  109  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  83.55 
 
 
624 bp  103  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0480  isochorismatase hydrolase  85.25 
 
 
648 bp  99.6  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702757  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1009  isochorismatase family protein  80.65 
 
 
627 bp  97.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1001  isochorismatase hydrolase  83.22 
 
 
627 bp  93.7  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0711  isochorismatase superfamily hydrolase  79.5 
 
 
621 bp  85.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.175294  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0070  isochorismatase hydrolase  82.79 
 
 
414 bp  75.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0758    82.69 
 
 
595 bp  63.9  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2840  putative hydrolase  84.42 
 
 
681 bp  58  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33420  putative hydrolase  83.12 
 
 
681 bp  50.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.0254919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>