27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1034 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1034  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 223 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00209659  normal  0.0192304 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1328  Methyltransferase type 12  34.92 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2656  methyltransferase type 12  40.38 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.607751  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2070  methyltransferase type 12  38.65 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2343  Methyltransferase type 12  36.54 
 
 		 246 aa  111  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8636  methyltransferase type 12  35.44 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3388  Methyltransferase type 12  35.38 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.464354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2688  Methyltransferase type 12  32.34 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.58 
 
 		 264 aa  52  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  31.79 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  37.14 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0029  hypothetical protein  31.01 
 
 		 273 aa  45.8  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  28.16 
 
 		 238 aa  45.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  26.82 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3054  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.61 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  28.1 
 
 		 586 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1167  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.51 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000217887  hitchhiker  0.00731668 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1588  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.666171  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  32.59 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3609  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  29.09 
 
 		 405 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE, putative  32.2 
 
 		 256 aa  42  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 		 263 aa  42  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  41.03 
 
 		 255 aa  42  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0205  hypothetical protein  29.61 
 
 		 267 aa  42  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0716517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>