20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2656 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2656  methyltransferase type 12  100 
 
 
246 aa  488  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.607751  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2070  methyltransferase type 12  81.63 
 
 
246 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2343  Methyltransferase type 12  46.22 
 
 
246 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1034  Methyltransferase type 12  40.38 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00209659  normal  0.0192304 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1328  Methyltransferase type 12  29.96 
 
 
247 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8636  methyltransferase type 12  35.71 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3388  Methyltransferase type 12  35.84 
 
 
256 aa  65.1  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.464354 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4494  hypothetical protein  21.62 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4455  hypothetical protein  22.16 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.821165 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4508  hypothetical protein  22.16 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4222  methyltransferase type 11  22.16 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4603  hypothetical protein  22.16 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.964338  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4271  hypothetical protein  22.16 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208511  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4457  hypothetical protein  21.88 
 
 
212 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.643189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4119  hypothetical protein  22.16 
 
 
212 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0995588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4108  hypothetical protein  22.16 
 
 
212 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404315  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  27.7 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0742  hypothetical protein  21.62 
 
 
212 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
339 aa  42  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2688  Methyltransferase type 12  27.21 
 
 
256 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0275961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>