74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3834 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3834  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0388523  normal  0.180061 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2423  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.29 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0228  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.15 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0212  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.15 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0761648 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1124  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.14 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.546055 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0798  hypothetical protein  23.98 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000907373  normal  0.0776345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3595  hypothetical protein  23.98 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0906121  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3467  hypothetical protein  23.98 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0577  hypothetical protein  25.53 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.825629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3630  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.13 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0263  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.59 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0724  GPR1/FUN34/yaaH  24.06 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0009  hypothetical protein  26.49 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0011  hypothetical protein  25.95 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.708242  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3586  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.95 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1357  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.28 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0010  hypothetical protein  25.95 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00010  conserved inner membrane protein associated with acetate transport  25.95 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0011  hypothetical protein  25.95 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00010  hypothetical protein  25.95 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3645  hypothetical protein  25.53 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0009  hypothetical protein  25.41 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0009  hypothetical protein  25.41 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0009  hypothetical protein  25.41 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.396236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0009  hypothetical protein  25.41 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.350527  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.6 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444258  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0009  hypothetical protein  30.95 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.06 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.954499  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0580  hypothetical protein  28.89 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1050  GPR1/FUN34/yaaH family protein  23.74 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0010  hypothetical protein  25.41 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0605  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.27 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1480  permease  38.89 
 
 		 189 aa  48.9  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1348  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.27 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00408603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3660  hypothetical protein  29.76 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.444217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1108  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.06 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215615 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1320  membrane protein  36.84 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0890  GPR1/FUN34/yaaH family protein  23.08 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.400956  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0541  hypothetical protein  27.91 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.49636  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2076  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.29 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3855  hypothetical protein  29.07 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1327  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.1 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.39924  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3180  GPR1/FUN34/yaaH family protein  22.99 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0524  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.51 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3588  gpr1/fun34/yaaH family protein  22.46 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3002  GPR1/FUN34/yaaH family protein  22.46 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  0.240175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3083  GPR1/FUN34/yaaH family protein  22.46 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0605595  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  22.99 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.264314  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0299  hypothetical protein  22.96 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01082  hypothetical protein  24.32 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0691  hypothetical protein  25.25 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.003925  hitchhiker  0.00210263 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1006  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.38 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0753776  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2835  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.76 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.244228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3478  GPR1/FUN34/yaaH family protein  22.53 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1075  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.38 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3283  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.38 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0944573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0695  gpr1/fun34/YaaH family protein  26.19 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0999  hypothetical protein  23.53 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0755  GPR1/FUN34/yaaH  25 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.830173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0904  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.19 
 
 		 188 aa  44.7  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1117  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.74 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0710546  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004328  hypothetical protein  22.92 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0634  GPR1/FUN34/yaaH  30.38 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0870411  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1224  transcriptional regulator  29.11 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1410  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0237  Gpr1/Fun34/YaaH family protein  22.78 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0492  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.41 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2192  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.51 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032608 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0666  GPR1/FUN34/yaaH family protein  31.19 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0435275  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0065  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.57 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0552  hypothetical protein  25.88 
 
 		 194 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.85069e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0029  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35.62 
 
 		 223 aa  42  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1126  GPR1/FUN34/yaaH  24.04 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22570  predicted membrane protein  31.4 
 
 		 197 aa  41.6  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>