19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1836 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1836  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  100 
 
 
699 aa  1402    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000209584  normal  0.179835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3152  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  46.75 
 
 
704 aa  508  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.486668  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0396  glycoside hydrolase family 81  37.77 
 
 
638 aa  372  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.803037  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0232  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  39.01 
 
 
729 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  31.15 
 
 
773 aa  233  9e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  30.54 
 
 
1067 aa  225  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  31.64 
 
 
1139 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7891  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  30.96 
 
 
971 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798967  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1332  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  30.3 
 
 
1010 aa  211  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137473  hitchhiker  0.00217358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2130  hypothetical protein  30.98 
 
 
758 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.251457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3302  glycoside hydrolase family 81  30.56 
 
 
931 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  28.47 
 
 
1238 aa  179  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.2 
 
 
1139 aa  133  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42567  beta-glucan elicitor receptor  36.73 
 
 
1208 aa  128  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.453891  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60116  endo-1,3-beta- glucanase  28.65 
 
 
755 aa  119  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266835  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64411  endo-1,3-beta-glucanase Daughter Specific Expression 4  28.21 
 
 
969 aa  117  6.9999999999999995e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.644497 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42898  endo-1,3-beta-glucanase  27.21 
 
 
1058 aa  107  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.127603  normal  0.94847 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00472  putative endo beta 1,3 glucanase, GH81 family (Eurofung)  30.03 
 
 
907 aa  97.8  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981548  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46976  endo-1,3-beta-glucosidase  27.53 
 
 
918 aa  82.4  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>