19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42898 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_42898  endo-1,3-beta-glucanase  100 
 
 
1058 aa  2154    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.127603  normal  0.94847 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64411  endo-1,3-beta-glucanase Daughter Specific Expression 4  58.13 
 
 
969 aa  895    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.644497 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60116  endo-1,3-beta- glucanase  40.32 
 
 
755 aa  550  1e-155  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266835  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00472  putative endo beta 1,3 glucanase, GH81 family (Eurofung)  41.12 
 
 
907 aa  546  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981548  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42567  beta-glucan elicitor receptor  27.6 
 
 
1208 aa  158  6e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.453891  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1332  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  30.15 
 
 
1010 aa  124  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137473  hitchhiker  0.00217358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2130  hypothetical protein  26.23 
 
 
758 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.251457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  30.31 
 
 
1139 aa  123  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  28.69 
 
 
1067 aa  120  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7891  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  28.48 
 
 
971 aa  120  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798967  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46976  endo-1,3-beta-glucosidase  29.6 
 
 
918 aa  113  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3302  glycoside hydrolase family 81  27.85 
 
 
931 aa  112  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1836  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  27.21 
 
 
699 aa  106  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000209584  normal  0.179835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 
773 aa  106  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3152  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  25.89 
 
 
704 aa  98.6  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.486668  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.6 
 
 
1139 aa  97.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0232  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  35.23 
 
 
729 aa  87.8  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0396  glycoside hydrolase family 81  24.66 
 
 
638 aa  79.7  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.803037  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  33.99 
 
 
1238 aa  78.6  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>