19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2130 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2130  hypothetical protein  100 
 
 		 758 aa  1535    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.251457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3302  glycoside hydrolase family 81  65.69 
 
 		 931 aa  964    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  48.65 
 
 		 1139 aa  687    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7891  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  46.77 
 
 		 971 aa  632  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1332  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  43.81 
 
 		 1010 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137473  hitchhiker  0.00217358 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  42.36 
 
 		 773 aa  546  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  40.21 
 
 		 1067 aa  499  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  31.71 
 
 		 1238 aa  330  6e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.81 
 
 		 1139 aa  225  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1836  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  30.72 
 
 		 699 aa  192  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000209584  normal  0.179835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3152  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  29.52 
 
 		 704 aa  162  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.486668  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0396  glycoside hydrolase family 81  28.23 
 
 		 638 aa  151  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.803037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64411  endo-1,3-beta-glucanase Daughter Specific Expression 4  28.22 
 
 		 969 aa  123  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.644497 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00472  putative endo beta 1,3 glucanase, GH81 family (Eurofung)  28.84 
 
 		 907 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42898  endo-1,3-beta-glucanase  26.27 
 
 		 1058 aa  122  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.127603  normal  0.94847 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42567  beta-glucan elicitor receptor  30.63 
 
 		 1208 aa  119  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.453891  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60116  endo-1,3-beta- glucanase  29.7 
 
 		 755 aa  108  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0232  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  27.45 
 
 		 729 aa  101  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46976  endo-1,3-beta-glucosidase  24.53 
 
 		 918 aa  70.5  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>