25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1332 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1332  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  100 
 
 
1010 aa  2013    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137473  hitchhiker  0.00217358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7891  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  60.08 
 
 
971 aa  892    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798967  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3302  glycoside hydrolase family 81  41.71 
 
 
931 aa  629  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  42.86 
 
 
1139 aa  573  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2130  hypothetical protein  43.6 
 
 
758 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.251457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  39.45 
 
 
773 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  37.3 
 
 
1067 aa  442  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  30.93 
 
 
1238 aa  310  6.999999999999999e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.79 
 
 
1139 aa  213  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1836  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  30.57 
 
 
699 aa  201  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000209584  normal  0.179835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3152  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  31.7 
 
 
704 aa  154  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.486668  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0396  glycoside hydrolase family 81  27.76 
 
 
638 aa  146  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.803037  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00472  putative endo beta 1,3 glucanase, GH81 family (Eurofung)  32.23 
 
 
907 aa  134  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981548  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0232  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  34.3 
 
 
729 aa  133  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64411  endo-1,3-beta-glucanase Daughter Specific Expression 4  29.97 
 
 
969 aa  130  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.644497 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42898  endo-1,3-beta-glucanase  30.15 
 
 
1058 aa  125  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.127603  normal  0.94847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  42.86 
 
 
1887 aa  118  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42567  beta-glucan elicitor receptor  27.59 
 
 
1208 aa  113  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.453891  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60116  endo-1,3-beta- glucanase  27.19 
 
 
755 aa  105  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266835  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46976  endo-1,3-beta-glucosidase  28.13 
 
 
918 aa  82.4  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  50 
 
 
1281 aa  53.9  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  53.19 
 
 
329 aa  51.2  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  54.9 
 
 
431 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  46.51 
 
 
268 aa  45.8  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  50 
 
 
430 aa  45.8  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.197658 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>