20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3302 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2130  hypothetical protein  64.91 
 
 
758 aa  976    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.251457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3302  glycoside hydrolase family 81  100 
 
 
931 aa  1859    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7891  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  44.93 
 
 
971 aa  702    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798967  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  45.14 
 
 
1139 aa  652    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1332  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  44.87 
 
 
1010 aa  551  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137473  hitchhiker  0.00217358 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  39.56 
 
 
773 aa  535  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  38.93 
 
 
1067 aa  484  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  30.99 
 
 
1238 aa  323  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.88 
 
 
1139 aa  208  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1836  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  30.56 
 
 
699 aa  184  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000209584  normal  0.179835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3152  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  30.31 
 
 
704 aa  154  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.486668  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0396  glycoside hydrolase family 81  29.71 
 
 
638 aa  140  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.803037  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42567  beta-glucan elicitor receptor  27.9 
 
 
1208 aa  123  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.453891  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  40.12 
 
 
1887 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42898  endo-1,3-beta-glucanase  27.98 
 
 
1058 aa  109  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.127603  normal  0.94847 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64411  endo-1,3-beta-glucanase Daughter Specific Expression 4  25.67 
 
 
969 aa  107  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.644497 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60116  endo-1,3-beta- glucanase  25.8 
 
 
755 aa  103  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266835  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0232  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  28.26 
 
 
729 aa  103  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00472  putative endo beta 1,3 glucanase, GH81 family (Eurofung)  27.51 
 
 
907 aa  96.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981548  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46976  endo-1,3-beta-glucosidase  27.74 
 
 
918 aa  73.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>