More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0412 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0412  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0110  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0138501  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0107  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0531774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0100  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.925668  decreased coverage  0.00140231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0090  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0093  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0092  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0108  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0112  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0083  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208848  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0102  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.872773  hitchhiker  0.00341362 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0098  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.514232  decreased coverage  0.00128262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0082  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0195288  normal  0.0518693 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0099  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.69188  decreased coverage  0.00129939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0067  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00450958  hitchhiker  0.000893697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0063  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00314729  hitchhiker  0.000241423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0064  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0037637  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0062  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124144  hitchhiker  0.000239512 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0101  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.893911  decreased coverage  0.00145589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0091  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0061  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.000243294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0065  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0014321  hitchhiker  0.000837814 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0078  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0079  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0078  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0634809  normal  0.33041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0079  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.060888  normal  0.335766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52320  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0074  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0075  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0076  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.195191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0080  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654019  normal  0.0862038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4588  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0010  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394112 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0008  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0031  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0024  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.459339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0023  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0017  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0008  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510749  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0029  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159006  normal  0.829895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0037  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0416385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0024  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0037  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.110584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0018  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0031  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0039  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t56  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA63  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2749  tRNA-Met  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000330212  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3197t  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t029  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t030  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3199t  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.976924  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0045  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0057  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00956422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3203t  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3126t  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.355044  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0633  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.811273  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0043  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.343772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0059  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00352122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0038  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0258342  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3201t  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0058  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00863094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0045  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0031  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169979  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0070  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0237567  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1218  tRNA-Met  94.74 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.784527  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t71  tRNA-Met  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0872657  hitchhiker  0.00727048 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-1  tRNA-Met  92.06 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-2  tRNA-Met  92.06 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Met-3  tRNA-Met  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.390156  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0048  tRNA-Met  92.06 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.726502  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0094  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0048  tRNA-Met  92.06 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0036  tRNA-Met  92.06 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382466  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0096  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0017  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2751  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.74519e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60270  tRNA-Met  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet01  tRNA-Met  93.22 
 
 		 80 bp  85.7  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0032  tRNA-Met  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0335468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0036  tRNA-Met  92.06 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62790  tRNA-Met  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5465  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.239722  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3204t  tRNA-Met  92.06 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0045  tRNA-Met  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207036  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60370  tRNA-Met  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0005  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.098649 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA22  tRNA-Met  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R21  tRNA-Met  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.69623  normal  0.0537905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R22  tRNA-Met  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691198  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0031  tRNA-Met  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0036  tRNA-Met  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0037  tRNA-Met  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>