More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_R0070 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_R0070  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0237567  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0039  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0008  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0037  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0416385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0018  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0008  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510749  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0024  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0023  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0016  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0039  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0049  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0037  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.110584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0010  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394112 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0022  tRNA-Met  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0024  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.459339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0029  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159006  normal  0.829895 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0058  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0349408  decreased coverage  0.0094622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0017  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0031  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0031  tRNA-Met  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15848  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t71  tRNA-Met  93.85 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0872657  hitchhiker  0.00727048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0094  tRNA-Met  93.85 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  93.85 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0017  tRNA-Met  93.85 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0096  tRNA-Met  93.85 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  93.85 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  93.85 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet01  tRNA-Met  93.85 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5465  tRNA-Met  93.85 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.239722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62790  tRNA-Met  93.85 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1218  tRNA-Met  93.85 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.784527  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0007  tRNA-Met  93.85 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0038  tRNA-Met  93.85 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21039  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0005  tRNA-Met  93.85 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.098649 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60370  tRNA-Met  93.85 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60270  tRNA-Met  93.85 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2751  tRNA-Met  93.85 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.74519e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6011  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.991195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0046  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0081  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.681899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0054  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.965262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0068  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.347514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0076  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00786304  normal  0.218816 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0007  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0188037  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00053  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00057  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0019  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.69794  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0082  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0688432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0013  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0052  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00733518  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0088  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0282515  hitchhiker  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3185  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0021    94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.24709  hitchhiker  0.00028661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3990  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3227  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0186102  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0081  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0699076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0046  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0048  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.459863  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0054  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0060  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0056  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0027  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0082  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3226  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0172509  normal  0.439997 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0057  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492622  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0633  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.811273  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0019  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0087  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00788985  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0019  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3215  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4213  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.355481  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2956  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.211186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2957  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2955  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.14009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4212  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353774  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3467  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139541  normal  0.865403 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3661  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.677335  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0025  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.279282  normal  0.0688605 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4693  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4695  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4694  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0080  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0693639  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4276  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4700  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00322718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4214  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0081  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0120643  normal  0.12492 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5065  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133786  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0171  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4696  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0089  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0276092  hitchhiker  0.00000375071 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0026  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116452  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5071  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA11  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5066  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.126908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>