More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_t1218 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_t1218  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.784527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60270  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62790  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60370  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5465  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.239722  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0037  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0010  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t56  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA63  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0037  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.110584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0031  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0031  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0018  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0008  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510749  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0039  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0016  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0008  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0037  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0416385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0029  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159006  normal  0.829895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0023  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0045  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0031  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169979  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0017  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0024  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.459339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0024  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0044  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0061  tRNA-Met  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t71  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0872657  hitchhiker  0.00727048 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0024  tRNA-Met  93.24 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R19  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000168289  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0005  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.098649 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet01  tRNA-Met  91.89 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52320  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0096  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0007  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0038  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21039  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0064  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2751  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.74519e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0094  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4588  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0070  tRNA-Met  93.85 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0237567  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0022  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0017  tRNA-Met  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0088  tRNA-Met  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00053  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0019  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.69794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0019  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0021  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0020  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0048  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.459863  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0054  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0060  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0034  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0081  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0699076  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0633  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.811273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2955  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.14009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5066  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.126908  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0091  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0033  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0177  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.202779  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0102  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.872773  hitchhiker  0.00341362 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3227  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0186102  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0082  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0688432  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0080  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0693639  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0052  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00733518  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3990  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5071  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102189  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5065  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133786  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0098  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.514232  decreased coverage  0.00128262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0083  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208848  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0080  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654019  normal  0.0862038 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5064  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0091  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000136537  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0039  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0101  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.893911  decreased coverage  0.00145589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0026  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116452  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0125  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000166673  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0081  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0120643  normal  0.12492 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0100  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.925668  decreased coverage  0.00140231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0092  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0090  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0107  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0531774  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0171  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761498  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0110  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0138501  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0093  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0088  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0282515  hitchhiker  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0099  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.69188  decreased coverage  0.00129939 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3226  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0172509  normal  0.439997 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0145  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000566193  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0112  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>