32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1737 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1737  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  440  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.968914  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1931  CTP-dependent riboflavin kinase  59.43 
 
 		 175 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1112  CTP-dependent riboflavin kinase  35.57 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000584891  normal  0.0286744 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1629  hypothetical protein  34.87 
 
 		 222 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2359  hypothetical protein  35.2 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1259  hypothetical protein  34.55 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000016259  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0159  hypothetical protein  35.68 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1345  hypothetical protein  37.31 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.103959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2982  CTP-dependent riboflavin kinase  32.16 
 
 		 235 aa  121  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2512  protein of unknown function DUF120  35.2 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.351988  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2018  CTP-dependent riboflavin kinase  32.34 
 
 		 233 aa  118  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0940  hypothetical protein  36.7 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0747374 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1071  hypothetical protein  38.02 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1224  hypothetical protein  32.46 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000029199  normal  0.751406 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0355  protein of unknown function DUF120  31.73 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  0.16407 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0815  hypothetical protein  36.84 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.392356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1523  winged helix-turn-helix domain-containing protein/riboflavin kinase  35.33 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0941  CTP-dependent riboflavin kinase  30.93 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0777422  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1119  CTP-dependent riboflavin kinase  36.41 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0178918  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1724  winged helix-turn-helix domain-containing protein/riboflavin kinase  34.95 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.415205  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1301  hypothetical protein  29.95 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000141182 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0098  hypothetical protein  29.86 
 
 		 227 aa  95.1  7e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3829  CTP-dependent riboflavin kinase  30.34 
 
 		 218 aa  94.7  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0925  riboflavin kinase  36.22 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1183  riboflavin kinase  34.88 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.889382 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0768  riboflavin kinase  33.33 
 
 		 127 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1186  riboflavin kinase  37.12 
 
 		 130 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1492  riboflavin kinase  32.56 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.74214  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1422  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 309 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0392  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 300 aa  42  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4573  Transcriptional regulator-like protein  34.38 
 
 		 340 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3026  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 336 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0264473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>