28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1523 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1523  winged helix-turn-helix domain-containing protein/riboflavin kinase  100 
 
 
225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1724  winged helix-turn-helix domain-containing protein/riboflavin kinase  51.6 
 
 
223 aa  227  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.415205  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2512  protein of unknown function DUF120  44.39 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.351988  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2359  hypothetical protein  43.46 
 
 
222 aa  186  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2982  CTP-dependent riboflavin kinase  41.74 
 
 
235 aa  185  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0941  CTP-dependent riboflavin kinase  40 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0777422  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0159  hypothetical protein  42.06 
 
 
222 aa  177  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1112  CTP-dependent riboflavin kinase  43.69 
 
 
232 aa  175  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000584891  normal  0.0286744 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0355  protein of unknown function DUF120  41.4 
 
 
263 aa  171  6.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  0.16407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2018  CTP-dependent riboflavin kinase  39.23 
 
 
233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1259  hypothetical protein  37.38 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000016259  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1629  hypothetical protein  37.26 
 
 
222 aa  161  6e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3829  CTP-dependent riboflavin kinase  34.98 
 
 
218 aa  150  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0815  hypothetical protein  39.6 
 
 
210 aa  149  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.392356  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1224  hypothetical protein  38.78 
 
 
230 aa  148  6e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000029199  normal  0.751406 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1119  CTP-dependent riboflavin kinase  38.28 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0178918  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1071  hypothetical protein  38.54 
 
 
212 aa  142  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1345  hypothetical protein  36.14 
 
 
211 aa  142  4e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.103959  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0940  hypothetical protein  38.65 
 
 
211 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0747374 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1301  hypothetical protein  32.6 
 
 
227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000141182 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1737  hypothetical protein  35.33 
 
 
217 aa  116  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.968914  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1931  CTP-dependent riboflavin kinase  36.57 
 
 
175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0098  hypothetical protein  32.71 
 
 
227 aa  100  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0768  riboflavin kinase  39.84 
 
 
127 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1183  riboflavin kinase  37.5 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.889382 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0925  riboflavin kinase  36.92 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1492  riboflavin kinase  36.64 
 
 
132 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.74214  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1186  riboflavin kinase  32.03 
 
 
130 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>