18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1601 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1601  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  500  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.253838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2274  hypothetical protein  31.68 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3490  hypothetical protein  29.94 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0522  hypothetical protein  34.15 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.582583  normal  0.0215931 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0146  hypothetical protein  30.77 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3387  hypothetical protein  25.27 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0845009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1997  hypothetical protein  31.03 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0097  hypothetical protein  27.59 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06660  hypothetical protein  24.36 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3800  hypothetical protein  31.25 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00611211  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0100  hypothetical protein  24.9 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5006  hypothetical protein  30.91 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04425  hypothetical protein  25.87 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0006  hypothetical protein  26.07 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000157652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2893  hypothetical protein  27.78 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213192 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03107  hypothetical protein  32.33 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0635239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1589  hypothetical protein  25.71 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0006  hypothetical protein  32.14 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>