16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0146 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0146  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  624  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3800  hypothetical protein  38.06 
 
 
354 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00611211  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2893  hypothetical protein  34.91 
 
 
342 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.213192 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1860  hypothetical protein  30.26 
 
 
546 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0006  hypothetical protein  33.18 
 
 
270 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000157652 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1589  hypothetical protein  29.85 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134465  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03107  hypothetical protein  30.35 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0635239  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0006  hypothetical protein  28.89 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1601  hypothetical protein  30.77 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.253838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0522  hypothetical protein  28.48 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.582583  normal  0.0215931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3387  hypothetical protein  24.11 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0845009  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2274  hypothetical protein  24.52 
 
 
274 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0097  hypothetical protein  22.91 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1997  hypothetical protein  23.6 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06660  hypothetical protein  22.39 
 
 
265 aa  46.2  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0100  hypothetical protein  19.44 
 
 
266 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>