15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2893 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2893  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  698    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.213192 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1860  hypothetical protein  39.38 
 
 
546 aa  195  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3800  hypothetical protein  38.03 
 
 
354 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00611211  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0146  hypothetical protein  34.91 
 
 
300 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1589  hypothetical protein  26.15 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134465  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0006  hypothetical protein  29.37 
 
 
237 aa  59.7  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0006  hypothetical protein  27.07 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000157652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0097  hypothetical protein  26.78 
 
 
274 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1601  hypothetical protein  27.78 
 
 
247 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.253838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3490  hypothetical protein  26.26 
 
 
264 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425617  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0522  hypothetical protein  27.27 
 
 
265 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.582583  normal  0.0215931 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04425  hypothetical protein  26.92 
 
 
256 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2274  hypothetical protein  26.07 
 
 
274 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03107  hypothetical protein  22.9 
 
 
269 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0635239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3387  hypothetical protein  22.54 
 
 
257 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0845009  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>