10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1589 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1589  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  553  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0006  hypothetical protein  45.07 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0006  hypothetical protein  33.08 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000157652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3800  hypothetical protein  29.77 
 
 		 354 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00611211  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0146  hypothetical protein  29.85 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03107  hypothetical protein  31.33 
 
 		 269 aa  89.4  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0635239  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2893  hypothetical protein  26.15 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1601  hypothetical protein  25.71 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.253838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2274  hypothetical protein  25.29 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3387  hypothetical protein  28.47 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0845009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>