48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4451 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4451  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  588  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.855168  normal  0.326439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4339  hypothetical protein  93.6 
 
 
297 aa  552  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0462859  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3971  hypothetical protein  91.36 
 
 
301 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.498714  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5158  hypothetical protein  74.24 
 
 
297 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2358  hypothetical protein  52.72 
 
 
297 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000267002  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6365  hypothetical protein  53.24 
 
 
299 aa  259  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1758  hypothetical protein  44.75 
 
 
297 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4131  hypothetical protein  47.3 
 
 
297 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6651  hypothetical protein  46.43 
 
 
305 aa  222  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5115  hypothetical protein  41.39 
 
 
309 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.206453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1040  hypothetical protein  36.99 
 
 
327 aa  186  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5759  hypothetical protein  39.43 
 
 
310 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00469268  unclonable  8.69143e-16 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1773  NAD(+) kinase  32.35 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3408  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  26.47 
 
 
292 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0584  NAD(+) kinase  30 
 
 
268 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1488  ATP-NAD/AcoX kinase  28.68 
 
 
301 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2650  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.08 
 
 
302 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.33 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2481  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.08 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.33 
 
 
300 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0440  ATP-NAD/AcoX kinase  30.71 
 
 
278 aa  47  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000434434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1035  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.33 
 
 
318 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2887  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.33 
 
 
312 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3488  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.58 
 
 
306 aa  46.6  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000826356 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.33 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.33 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.33 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0902  NAD(+) kinase  30.53 
 
 
269 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00230325  normal  0.504909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  29.32 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_4074  predicted protein  26.6 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0833  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.82 
 
 
298 aa  44.3  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110049  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0744  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.33 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0260  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.33 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.58 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3334  NAD(+)/NADH kinase family protein  28.78 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2339  ATP-NAD/AcoX kinase  31.5 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.185835 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0714  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.33 
 
 
300 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2432  ATP-NAD/AcoX kinase  26.32 
 
 
285 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2213  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.82 
 
 
344 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1106  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.82 
 
 
320 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0983  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.66 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.709246 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2332  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.82 
 
 
300 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0724  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  22.28 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2573  NAD(+) kinase  28.46 
 
 
285 aa  42.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.108647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0493  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.82 
 
 
300 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2640  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.33 
 
 
300 aa  42.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.42258  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2050  NAD(+) kinase  25.56 
 
 
285 aa  42.4  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04330  ATP-NAD kinase  28.26 
 
 
294 aa  42.4  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>