14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5759 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5759  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  625  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00469268  unclonable  8.69143e-16 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5115  hypothetical protein  61.94 
 
 
309 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.206453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1040  hypothetical protein  51.7 
 
 
327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6365  hypothetical protein  41.55 
 
 
299 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5158  hypothetical protein  38.54 
 
 
297 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4339  hypothetical protein  39.43 
 
 
297 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0462859  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4451  hypothetical protein  39.43 
 
 
297 aa  186  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.855168  normal  0.326439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3971  hypothetical protein  37.7 
 
 
301 aa  175  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.498714  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2358  hypothetical protein  38.44 
 
 
297 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000267002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1758  hypothetical protein  35.62 
 
 
297 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6651  hypothetical protein  34.5 
 
 
305 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4131  hypothetical protein  35.41 
 
 
297 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2573  NAD(+) kinase  31.78 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.108647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2481  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.56 
 
 
312 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>