32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3971 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3971  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  593  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.498714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4339  hypothetical protein  96.35 
 
 		 297 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0462859  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4451  hypothetical protein  91.36 
 
 		 297 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.855168  normal  0.326439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5158  hypothetical protein  74.25 
 
 		 297 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2358  hypothetical protein  53.54 
 
 		 297 aa  268  8e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000267002  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6365  hypothetical protein  53.87 
 
 		 299 aa  252  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1758  hypothetical protein  45.64 
 
 		 297 aa  232  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4131  hypothetical protein  47.67 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6651  hypothetical protein  44.26 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1040  hypothetical protein  37.15 
 
 		 327 aa  178  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5759  hypothetical protein  37.7 
 
 		 310 aa  175  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00469268  unclonable  8.69143e-16 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5115  hypothetical protein  40.52 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.206453 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1773  NAD(+) kinase  33.81 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3408  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  26.01 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0584  NAD(+) kinase  28.78 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2650  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.33 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2481  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.33 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1488  ATP-NAD/AcoX kinase  30.22 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2887  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.58 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2339  ATP-NAD/AcoX kinase  31.58 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.185835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1035  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.09 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2432  ATP-NAD/AcoX kinase  25.76 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0902  NAD(+) kinase  29.29 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00230325  normal  0.504909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3488  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.6 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000826356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1049  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.73 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0798943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0612  ATP-NAD/AcoX kinase  27.01 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0451  ATP-NAD kinase  27.01 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2050  NAD(+) kinase  25 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0724  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  23.53 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  29.85 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0440  ATP-NAD/AcoX kinase  29.23 
 
 		 278 aa  42.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000434434 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2573  NAD(+) kinase  27.07 
 
 		 285 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.108647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>