16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6651 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6651  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  608  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2358  hypothetical protein  58.36 
 
 
297 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000267002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1758  hypothetical protein  52.79 
 
 
297 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4131  hypothetical protein  55.19 
 
 
297 aa  280  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5158  hypothetical protein  45.72 
 
 
297 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4451  hypothetical protein  46.43 
 
 
297 aa  228  8e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.855168  normal  0.326439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3971  hypothetical protein  44.26 
 
 
301 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.498714  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6365  hypothetical protein  45.75 
 
 
299 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4339  hypothetical protein  44.59 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0462859  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5759  hypothetical protein  34.5 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00469268  unclonable  8.69143e-16 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5115  hypothetical protein  37.03 
 
 
309 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.206453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1040  hypothetical protein  33.63 
 
 
327 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_4074  predicted protein  30.63 
 
 
273 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0484  NAD(+) kinase  30.77 
 
 
256 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0549  NAD(+) kinase  30.77 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0902  NAD(+) kinase  28.78 
 
 
269 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00230325  normal  0.504909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>