16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5115 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5115  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  628  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.206453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5759  hypothetical protein  61.94 
 
 
310 aa  384  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00469268  unclonable  8.69143e-16 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1040  hypothetical protein  55.28 
 
 
327 aa  354  8.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6365  hypothetical protein  42.05 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4451  hypothetical protein  41.39 
 
 
297 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.855168  normal  0.326439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4339  hypothetical protein  41.06 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0462859  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5158  hypothetical protein  39.74 
 
 
297 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3971  hypothetical protein  40.52 
 
 
301 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.498714  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1758  hypothetical protein  36.81 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2358  hypothetical protein  38.11 
 
 
297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000267002  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4131  hypothetical protein  36.63 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6651  hypothetical protein  37.03 
 
 
305 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6912  ATP-NAD/AcoX kinase  28.48 
 
 
285 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1773  NAD(+) kinase  30.83 
 
 
301 aa  43.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0863  NAD(+) kinase  30.3 
 
 
263 aa  42.7  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302398  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1035  NAD(+)/NADH kinase family protein  29.01 
 
 
318 aa  42.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>