37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3398 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3398  MEKHLA domain protein  100 
 
 
146 aa  289  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3526  MEKHLA domain protein  81.51 
 
 
147 aa  236  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.897252  normal  0.184642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3202  MEKHLA domain-containing protein  81.51 
 
 
147 aa  235  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.888001 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02707  hypothetical protein  67.59 
 
 
146 aa  197  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.363866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1410  MEKHLA domain protein  62.68 
 
 
154 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.842617  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4480  MEKHLA domain-containing protein  65.49 
 
 
147 aa  174  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0667003  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5830  MEKHLA domain-containing protein  54.79 
 
 
153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2107  hypothetical protein  58.33 
 
 
153 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5404  MEKHLA domain protein  56.34 
 
 
159 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2037  hypothetical protein  57.14 
 
 
157 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0596866  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1015  hypothetical protein  57.14 
 
 
155 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2092  hypothetical protein  57.14 
 
 
155 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2234  hypothetical protein  57.14 
 
 
155 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0773344  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6081  hypothetical protein  51.37 
 
 
152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0479764  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5845  MEKHLA domain-containing protein  50.68 
 
 
152 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633795  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0608  hypothetical protein  47.79 
 
 
157 aa  120  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3312  MEKHLA domain protein  42.86 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2229  MEKHLA domain-containing protein  48.62 
 
 
159 aa  107  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0755  hypothetical protein  41.48 
 
 
146 aa  103  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3256  hypothetical protein  39.42 
 
 
159 aa  103  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2107  hypothetical protein  42.54 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.331379  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3445  MEKHLA domain protein  36.5 
 
 
158 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2659  MEKHLA domain protein  36.5 
 
 
158 aa  95.9  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2177  hypothetical protein  38.36 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0268  hypothetical protein  36.09 
 
 
160 aa  91.3  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2523  hypothetical protein  38.19 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.256776  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1380  MEKHLA domain protein  39.81 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10568  predicted protein  38.89 
 
 
140 aa  84  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0449986  normal  0.0211717 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28401  hypothetical protein  42.42 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1970  hypothetical protein  32.71 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5439  hypothetical protein  73.81 
 
 
49 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0518  MEKHLA domain protein  40.78 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9007  predicted protein  31.37 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 
705 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.39 
 
 
2468 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1893  LOV-regulator, Blue-light sensing  42.19 
 
 
920 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423791  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 
1088 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>