39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3202 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3202  MEKHLA domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  291  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.888001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3526  MEKHLA domain protein  98.64 
 
 
147 aa  288  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.897252  normal  0.184642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3398  MEKHLA domain protein  81.51 
 
 
146 aa  235  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02707  hypothetical protein  68.97 
 
 
146 aa  207  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.363866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4480  MEKHLA domain-containing protein  65.73 
 
 
147 aa  179  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0667003  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1410  MEKHLA domain protein  61.27 
 
 
154 aa  174  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.842617  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5830  MEKHLA domain-containing protein  54.17 
 
 
153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5404  MEKHLA domain protein  57.04 
 
 
159 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2037  hypothetical protein  54.79 
 
 
157 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0596866  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1015  hypothetical protein  54.79 
 
 
155 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2092  hypothetical protein  54.79 
 
 
155 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2234  hypothetical protein  54.79 
 
 
155 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0773344  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2107  hypothetical protein  54.73 
 
 
153 aa  150  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6081  hypothetical protein  51.06 
 
 
152 aa  144  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0479764  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5845  MEKHLA domain-containing protein  51.06 
 
 
152 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633795  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0608  hypothetical protein  47.06 
 
 
157 aa  122  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3312  MEKHLA domain protein  42.42 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3256  hypothetical protein  42.75 
 
 
159 aa  108  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2229  MEKHLA domain-containing protein  46.61 
 
 
159 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0755  hypothetical protein  44.44 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2107  hypothetical protein  41.18 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.331379  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2177  hypothetical protein  41.01 
 
 
159 aa  93.6  7e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0268  hypothetical protein  34.56 
 
 
160 aa  91.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1380  MEKHLA domain protein  34.56 
 
 
167 aa  90.5  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2523  hypothetical protein  41.01 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.256776  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28401  hypothetical protein  38.85 
 
 
158 aa  88.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2659  MEKHLA domain protein  34.53 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3445  MEKHLA domain protein  34.53 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1970  hypothetical protein  29.77 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10568  predicted protein  37.86 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0449986  normal  0.0211717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5439  hypothetical protein  70.73 
 
 
49 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0518  MEKHLA domain protein  42.31 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9007  predicted protein  29.41 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
832 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
573 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1295  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.36 
 
 
568 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
936 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 
639 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.43 
 
 
651 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>