27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5439 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5439  hypothetical protein  100 
 
 		 49 aa  104  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3398  MEKHLA domain protein  73.81 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1015  hypothetical protein  66.67 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2234  hypothetical protein  66.67 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0773344  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2037  hypothetical protein  66.67 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0596866  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2092  hypothetical protein  66.67 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3526  MEKHLA domain protein  70.73 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.897252  normal  0.184642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3202  MEKHLA domain-containing protein  70.73 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.888001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4480  MEKHLA domain-containing protein  68.29 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0667003  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02707  hypothetical protein  70.73 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.363866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1410  MEKHLA domain protein  65.85 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.842617  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5830  MEKHLA domain-containing protein  60.98 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6081  hypothetical protein  60.98 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0479764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5404  MEKHLA domain protein  56.1 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5845  MEKHLA domain-containing protein  58.54 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2229  MEKHLA domain-containing protein  58.54 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0755  hypothetical protein  55.81 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2107  hypothetical protein  55 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3256  hypothetical protein  48.78 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2107  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.331379  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0608  hypothetical protein  51.22 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0268  hypothetical protein  45 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2523  hypothetical protein  48.72 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.256776  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9007  predicted protein  44.74 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2659  MEKHLA domain protein  42.5 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3445  MEKHLA domain protein  42.5 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2177  hypothetical protein  46.15 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>